More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1978 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  927    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.09 
 
 
461 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 
562 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.13 
 
 
459 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 
458 aa  359  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.57 
 
 
458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.13 
 
 
473 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
477 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 
465 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.13 
 
 
470 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.29 
 
 
467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
581 aa  339  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.1 
 
 
473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  41.68 
 
 
585 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 
473 aa  336  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
472 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 
474 aa  335  7e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 
460 aa  335  7.999999999999999e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
472 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.86 
 
 
473 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.86 
 
 
473 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.26 
 
 
463 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.31 
 
 
463 aa  334  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  42.58 
 
 
472 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.94 
 
 
471 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.86 
 
 
473 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.62 
 
 
473 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 
477 aa  331  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.5 
 
 
480 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 
462 aa  331  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
584 aa  330  3e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
484 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.59 
 
 
480 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
470 aa  329  6e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 
473 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.44 
 
 
473 aa  329  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 
459 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.79 
 
 
479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.94 
 
 
459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
585 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 
459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 
459 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 
459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
468 aa  326  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
484 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
478 aa  324  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 
473 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 
465 aa  324  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.42 
 
 
483 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.71 
 
 
479 aa  323  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.23 
 
 
468 aa  323  6e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
465 aa  322  9.000000000000001e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 
459 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.38 
 
 
478 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.38 
 
 
478 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.47 
 
 
463 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.71 
 
 
479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.17 
 
 
478 aa  320  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.77 
 
 
459 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.68 
 
 
469 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.24 
 
 
481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 
470 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.88 
 
 
463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
478 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 
479 aa  319  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.51 
 
 
459 aa  319  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
473 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.94 
 
 
459 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3769  dihydrolipoamide dehydrogenase  38 
 
 
562 aa  319  7.999999999999999e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0026  dihydrolipoamide dehydrogenase  38 
 
 
563 aa  318  9e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000184744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.57 
 
 
478 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
467 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 
470 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.15 
 
 
459 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
474 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
467 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 
482 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 
475 aa  316  5e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.59 
 
 
492 aa  316  5e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
462 aa  315  7e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.59 
 
 
480 aa  315  9e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.36 
 
 
478 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.54 
 
 
481 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.81 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
478 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.09 
 
 
478 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.09 
 
 
478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.57 
 
 
476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  38.57 
 
 
478 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.36 
 
 
476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.79 
 
 
481 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 
459 aa  313  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>