More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1472 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 269 aa  558  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  43.92 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  42.69 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  41.98 
 
 		 274 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  41.94 
 
 		 285 aa  215  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  37.79 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  41.27 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  41.3 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  41.3 
 
 		 257 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  38.93 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  39.83 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.46 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  39.38 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  39.59 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  36.29 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  38.4 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  38.84 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  36.03 
 
 		 266 aa  195  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  37.8 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  35.5 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  41.96 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  36.12 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  40 
 
 		 260 aa  192  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  38.11 
 
 		 268 aa  191  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  40.24 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  38.68 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  38.17 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  37.5 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  37.55 
 
 		 261 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  36.05 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  38.71 
 
 		 259 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  34.72 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  38.24 
 
 		 272 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  34.47 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  37.97 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  38.26 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0155  ATP-binding component of ferric enterobactin transport  37.6 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  35.52 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  36.96 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  40.5 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  37.71 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  36.94 
 
 		 266 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.12 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.37 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  35.37 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  36.92 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 		 242 aa  163  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  34.34 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  34.43 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  35.25 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  33.61 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  33.86 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  35.8 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  37.11 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.06 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  36.13 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  36.69 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  34.66 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  34.41 
 
 		 269 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.13 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.13 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  32.13 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  35.66 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  34.84 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.13 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  35.69 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  34.44 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  38.34 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  35.74 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  32.66 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  34.6 
 
 		 419 aa  155  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1809  ABC transporter related  34.73 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  35.68 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  32.13 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  38.46 
 
 		 261 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  34.67 
 
 		 490 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.37 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.08 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  31.6 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  31.97 
 
 		 444 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>