More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1300 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1300  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 287 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1216  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.55 
 
 		 287 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2475  Thioredoxin-disulfide reductase  48.75 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000395489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2663  thioredoxin reductase  47.72 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2349  thioredoxin reductase  47.72 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1749  thioredoxin-disulfide reductase  45.58 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2134  Thioredoxin-disulfide reductase  43.55 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000266585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1139  thioredoxin-disulfide reductase  44.91 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.234557  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.64 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2606  Thioredoxin-disulfide reductase  41.64 
 
 		 309 aa  232  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234008  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  33.56 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  32.13 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  33.68 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  33.77 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  33 
 
 		 395 aa  142  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  33.88 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  31.63 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  33 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0698  thioredoxin-disulfide reductase  33.33 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468385  normal  0.685309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  32.89 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  31.91 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.9 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  30.03 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  31.1 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.86 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  30.79 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1964  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.11 
 
 		 509 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.21 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  29.47 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  28.62 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.07 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  33.33 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.85 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  29.58 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.44 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  30.32 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.59 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  33.55 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  31.88 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  35.41 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  35.41 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  35.41 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  35.41 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  30.33 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.54 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  34.1 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  29.67 
 
 		 317 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  34.21 
 
 		 320 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0709  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.56 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  32.87 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  30.43 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  30.07 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  28.62 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  31 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  26.71 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21210  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  29.68 
 
 		 523 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0675992  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  28.2 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0632  thioredoxin reductase (NADPH)  31.82 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00998267  normal  0.636604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.45 
 
 		 427 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  27.69 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  27.04 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  27.04 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  27.04 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  27.04 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  31.68 
 
 		 510 aa  125  9e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  27.04 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  27.04 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  27.04 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0080  thioredoxin-disulfide reductase  31.27 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0223  thioredoxin reductase  29.64 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  32.89 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  30.82 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  26.71 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  33.11 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  32.89 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  29.66 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  31.41 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  30.77 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  30.67 
 
 		 391 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3691  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.7 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0649931  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  29.45 
 
 		 569 aa  122  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  29.84 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  29.59 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  31.49 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  28.52 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  30.49 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  26.38 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0689  thioredoxin reductase  32.24 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.200381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  30.16 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  30.03 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  29.77 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  28.81 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  31.15 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.24 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  32.48 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  29.67 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0296  thioredoxin-disulfide reductase  30.52 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  30.29 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  29.74 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  30.1 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>