245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1185 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  58.89 
 
 		 192 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  56.04 
 
 		 185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  62.42 
 
 		 186 aa  207  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  60.49 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  60.49 
 
 		 208 aa  204  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  56.97 
 
 		 189 aa  201  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  48.91 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  47.8 
 
 		 196 aa  176  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  44.85 
 
 		 202 aa  171  7.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  47.16 
 
 		 196 aa  166  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  45.08 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  47.19 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  42.71 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  42.7 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  43.52 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  42.35 
 
 		 195 aa  157  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  42.93 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  45.55 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  41.85 
 
 		 188 aa  154  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  40.56 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  42.78 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  43.11 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  43.37 
 
 		 188 aa  150  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  46.71 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  45.68 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  43.01 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  42.54 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  45.4 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  41.67 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  43.92 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  42.86 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  40.88 
 
 		 184 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  40.21 
 
 		 206 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  39.78 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  43.86 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  43.01 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  40.44 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  40.21 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  41.15 
 
 		 210 aa  144  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0409  LemA family protein  41.15 
 
 		 210 aa  144  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  39.89 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  40.84 
 
 		 212 aa  144  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  44.83 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  39.89 
 
 		 183 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  37.63 
 
 		 197 aa  144  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  40.33 
 
 		 184 aa  144  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  36.31 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  39.67 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  39.67 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  43.82 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  38.8 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  39.38 
 
 		 194 aa  141  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  43.09 
 
 		 188 aa  140  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  44.44 
 
 		 208 aa  140  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0598  LemA family protein  40.61 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  40.72 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  42.53 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  38.8 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  40.93 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  44.15 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  40.53 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  42.86 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  43.93 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  41.24 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0896  LemA family protein  39.47 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.652606  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  42.53 
 
 		 224 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  42.53 
 
 		 224 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  40.24 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  42.53 
 
 		 224 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  42.53 
 
 		 224 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0313  hypothetical protein  42.53 
 
 		 226 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  42.53 
 
 		 224 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  42.53 
 
 		 224 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  41.38 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  38.89 
 
 		 180 aa  138  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  43.35 
 
 		 197 aa  137  7e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  42.69 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  41.28 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  38.95 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  38.95 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  40.72 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  40.36 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  40.72 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  42.76 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  40.8 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  40.72 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  41.94 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  43.52 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  41.03 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  40.51 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  42.93 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  40.21 
 
 		 207 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  40.21 
 
 		 207 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  42.86 
 
 		 249 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  41.97 
 
 		 211 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  39.66 
 
 		 244 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  40.23 
 
 		 202 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  39.69 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>