More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0426 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  100 
 
 		 498 aa  1009    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  44.96 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  42.39 
 
 		 501 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  42.77 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  42.24 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.13 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.37 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.77 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  41.15 
 
 		 505 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 505 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  40.73 
 
 		 508 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  39.18 
 
 		 861 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  40.69 
 
 		 522 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  40.93 
 
 		 508 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.51 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  40.29 
 
 		 511 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  41.32 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  39.76 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  40.34 
 
 		 516 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  40.7 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  39.47 
 
 		 511 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  40.85 
 
 		 498 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.96 
 
 		 495 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  40.52 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  39.52 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  40.65 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  40.45 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  39.47 
 
 		 520 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.08 
 
 		 511 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  41.16 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  40.65 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 		 502 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  40.12 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  39.43 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  38.6 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  40.33 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  39.92 
 
 		 495 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  39.79 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.77 
 
 		 516 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  40.29 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  39.88 
 
 		 499 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  40.56 
 
 		 519 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  41.26 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  40.53 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.59 
 
 		 504 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.48 
 
 		 506 aa  363  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.2 
 
 		 499 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.7 
 
 		 514 aa  363  4e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  39.88 
 
 		 537 aa  363  5.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  41.58 
 
 		 520 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  40.16 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  38.78 
 
 		 499 aa  362  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  41.31 
 
 		 497 aa  362  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  41.62 
 
 		 502 aa  362  8e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 		 494 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  41.09 
 
 		 517 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 		 494 aa  362  8e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2787  ABC transporter for sugar (aldose) ATP-binding protein  40.97 
 
 		 495 aa  362  8e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0149064  normal  0.48477 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 		 494 aa  362  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  41.01 
 
 		 501 aa  362  9e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  37.63 
 
 		 498 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  37.63 
 
 		 498 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  40.4 
 
 		 514 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 		 501 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.03 
 
 		 496 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  40.4 
 
 		 514 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  37.63 
 
 		 498 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 506 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  40.16 
 
 		 514 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  40.2 
 
 		 518 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 510 aa  360  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  38.9 
 
 		 496 aa  359  5e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  39.26 
 
 		 503 aa  359  5e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 506 aa  359  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 		 506 aa  359  7e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 		 506 aa  359  7e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 		 506 aa  359  7e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.63 
 
 		 506 aa  358  9e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 523 aa  358  9e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.88 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  37.45 
 
 		 511 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  41.21 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 		 525 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40.78 
 
 		 506 aa  358  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 515 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.34 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>