More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0425 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 317 aa  612  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 346 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  39.33 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  38.1 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  37.78 
 
 		 333 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  36.19 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  36.81 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  35.99 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  36.81 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  36.81 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  36.81 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.46 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  37.37 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0529  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  35.49 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  37.37 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 334 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  37.54 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.1 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  34.3 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.56 
 
 		 310 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  34.17 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.09 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  35.56 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.93 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2596  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107866  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.82 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  39.16 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 		 835 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 		 348 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  34.26 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  33.77 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  36.91 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  36.24 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  35.83 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  34.65 
 
 		 337 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  36.24 
 
 		 335 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.03 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.5 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  35.76 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1683  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0382426  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  36.67 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  36.09 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  35.1 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  33.89 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  33.44 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  34.71 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 337 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 		 335 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.21 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  31.01 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2841  monosaccharide-transporting ATPase  34.78 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.01 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0227  monosaccharide-transporting ATPase  35.46 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  0.0935895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  34.21 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  36.39 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  36.71 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  34.38 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 		 326 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  36.99 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  33.12 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  33.33 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>