78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1391 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1391  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  318  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783489 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  33.58 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  28.48 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  31.48 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  44.94 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  26.29 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  33.57 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  33.57 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  33.57 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  32.86 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  25.77 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  32.86 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  32.86 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  32.86 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  32.86 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  32.86 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  33.71 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  25.53 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  25.53 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  31.88 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  31.88 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  31.16 
 
 		 118 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  30.43 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  30.43 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  30.43 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  30.43 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  30.37 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  30.43 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  30.43 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  29.79 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  33.11 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  31.31 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  26.32 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  29.79 
 
 		 126 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0701  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  26.95 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  27.86 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  24.82 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  34.62 
 
 		 112 aa  48.5  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0829  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  27.85 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  28.89 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  23.57 
 
 		 125 aa  47.4  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  58.97 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  40.91 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  24.84 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  34.78 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  24.84 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  24.84 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  24.84 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  28 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  34.09 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  27.7 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  25 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  31.08 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  38.89 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  30.87 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  25.17 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  38.36 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  33.75 
 
 		 116 aa  44.7  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  31.86 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3162  hypothetical protein  33.66 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  25.17 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  30.67 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  25.77 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2214  hypothetical protein  27.88 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1868  protein of unknown function DUF805  27.88 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  34.88 
 
 		 109 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  31.82 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  21.99 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  33.93 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  28.29 
 
 		 157 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  35.29 
 
 		 109 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  54.84 
 
 		 68 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  29.37 
 
 		 141 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  28.3 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>