More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0510 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0510  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
208 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.585126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.56 
 
 
220 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3917  Glutathione S-transferase domain  58.18 
 
 
218 aa  229  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306349  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  53.67 
 
 
225 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.27 
 
 
218 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3927  Glutathione S-transferase domain  56.82 
 
 
218 aa  224  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  53.67 
 
 
225 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  52.05 
 
 
224 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.02 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  50.45 
 
 
220 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.13 
 
 
222 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  53.42 
 
 
222 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  53.21 
 
 
222 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.67 
 
 
222 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.83 
 
 
222 aa  208  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  53.67 
 
 
222 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  53.21 
 
 
222 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  53.67 
 
 
222 aa  204  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.21 
 
 
233 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  53.21 
 
 
233 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.21 
 
 
233 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  53.42 
 
 
229 aa  197  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  49.49 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.79 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  50 
 
 
232 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  47.85 
 
 
208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  47.37 
 
 
208 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  45.62 
 
 
223 aa  181  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  48.39 
 
 
221 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  43.89 
 
 
221 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.5 
 
 
221 aa  178  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1276  glutathione S-transferase-like  47.09 
 
 
208 aa  177  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.1 
 
 
208 aa  177  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.91 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252994  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  46.12 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3116  Glutathione S-transferase protein  45.78 
 
 
227 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.324582  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  43.36 
 
 
222 aa  167  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1665  Glutathione S-transferase domain protein  42.06 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.14 
 
 
208 aa  164  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4518  glutathione S-transferase, N- domain  44.89 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4612  glutathione S-transferase, N- domain  44.89 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520156  normal  0.373731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4611  glutathione S-transferase, N- domain  44.89 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.931981  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4662  glutathione S-transferase, N- domain  44.05 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4526  glutathione S-transferase, N- domain  44.89 
 
 
222 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  42.15 
 
 
232 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.15 
 
 
232 aa  161  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2125  glutathione S-transferase-like protein  43.06 
 
 
224 aa  161  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.850832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1936  Glutathione S-transferase domain protein  40.65 
 
 
214 aa  160  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.247506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4480  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.41 
 
 
229 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0622605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  41.95 
 
 
226 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  41.26 
 
 
208 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3813  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.64 
 
 
221 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.340281  normal  0.596227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  41.75 
 
 
215 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0874  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.1 
 
 
234 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650083 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  42.42 
 
 
205 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1722  glutathione S-transferase-like  37.04 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.226504  normal  0.784305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1093  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.58 
 
 
209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1542  glutathione S-transferase  36.57 
 
 
222 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.96 
 
 
208 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.96 
 
 
208 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.96 
 
 
208 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  37.13 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  35.64 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00629  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17010)  36.13 
 
 
255 aa  135  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0806169  normal  0.869816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  39.76 
 
 
208 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  34.65 
 
 
206 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  35.53 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  36.68 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  37.17 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6917  putative glutathione S-transferase  35.41 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35190  glutathione S-transferase  36.21 
 
 
245 aa  112  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0375  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.52 
 
 
121 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1010  glutathione S-transferase-like  37.86 
 
 
211 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 
202 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  88.2  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.6 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  31.6 
 
 
202 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56049  Glutathione S-transferase  32.6 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00620  glutathione transferase, putative  29.11 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295755  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  30.46 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  31.78 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0348  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  30.62 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2427  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340237  normal  0.0428234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  28.91 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  28.79 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  32.23 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  31.31 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.08 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.32 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  27.32 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  29.33 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.78 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  30.35 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.5 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1170  glutathione S-transferase  27.36 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>