More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
330 aa  674    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  77.44 
 
 
331 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  76.8 
 
 
333 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  76.8 
 
 
333 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  76.8 
 
 
333 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  74.45 
 
 
331 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  74.92 
 
 
336 aa  484  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  73.04 
 
 
335 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  73.4 
 
 
330 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  69.13 
 
 
318 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  65.4 
 
 
361 aa  421  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  67.43 
 
 
310 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  66.56 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  67 
 
 
310 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  66.01 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  68.11 
 
 
313 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  65.15 
 
 
346 aa  407  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  64.71 
 
 
310 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  64.59 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  65.3 
 
 
348 aa  391  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  65.25 
 
 
309 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  64.03 
 
 
330 aa  388  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  62.14 
 
 
332 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  65.23 
 
 
325 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  61.86 
 
 
340 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  61.31 
 
 
353 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  64.29 
 
 
327 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  63.25 
 
 
333 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  60.66 
 
 
348 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  65.06 
 
 
317 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  58.44 
 
 
318 aa  371  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  60.33 
 
 
318 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  64.42 
 
 
362 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  65.25 
 
 
329 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  59.93 
 
 
319 aa  368  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  59.61 
 
 
332 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  58.04 
 
 
333 aa  362  5.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  61.94 
 
 
344 aa  358  9e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  56.77 
 
 
334 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  61.61 
 
 
329 aa  345  8e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  57.55 
 
 
320 aa  341  8e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  54.34 
 
 
314 aa  341  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  54.72 
 
 
311 aa  341  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  54.72 
 
 
311 aa  340  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  54.34 
 
 
314 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  57.57 
 
 
325 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  60.6 
 
 
325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  55.76 
 
 
325 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  54.34 
 
 
313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  61.84 
 
 
327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  58.25 
 
 
317 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  57 
 
 
325 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  53.31 
 
 
334 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  53.42 
 
 
311 aa  333  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  54.07 
 
 
311 aa  332  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  53.09 
 
 
311 aa  328  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  53.75 
 
 
311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  48.3 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  51.11 
 
 
456 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  54.02 
 
 
314 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  48.71 
 
 
323 aa  319  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  50.15 
 
 
339 aa  318  7.999999999999999e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  48.91 
 
 
460 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  49.69 
 
 
461 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  49.69 
 
 
461 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  51.94 
 
 
320 aa  316  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  53.58 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  47.92 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  48.59 
 
 
453 aa  312  4.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  48.73 
 
 
315 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  51.31 
 
 
313 aa  310  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  50.5 
 
 
322 aa  309  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  48.41 
 
 
460 aa  309  5e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
320 aa  308  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  50.48 
 
 
345 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  51.13 
 
 
458 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  51.15 
 
 
314 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  53.62 
 
 
314 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
361 aa  305  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  48.43 
 
 
324 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  52.79 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  51.91 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  48.43 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  50 
 
 
322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  49.36 
 
 
457 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  50.64 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  52.15 
 
 
321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
319 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03581  Thioredoxin reductase (EC 1.8.1.9) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q08GE2]  47.35 
 
 
339 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.813979  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  50.5 
 
 
304 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  50.65 
 
 
313 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1248  thioredoxin reductase  47.5 
 
 
324 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.335568  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0056  thioredoxin reductase  50 
 
 
326 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
311 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  50.82 
 
 
321 aa  298  7e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  50 
 
 
318 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>