More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_27840  molecular chaperone  100 
 
 
658 aa  1313    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0363632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1415  Heat shock protein 70  54.06 
 
 
657 aa  633  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2974  Heat shock protein 70  47.4 
 
 
473 aa  324  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458744  normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04390  molecular chaperone  43.95 
 
 
665 aa  306  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48656  normal  0.554672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6569  Heat shock protein 70  51.15 
 
 
643 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0352  Heat shock protein 70  44.55 
 
 
858 aa  304  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6358  heat shock protein 70  46.15 
 
 
380 aa  290  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3675  Heat shock protein 70  48.73 
 
 
698 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201192  normal  0.0422878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2693  Heat shock protein 70  46 
 
 
597 aa  263  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122033  normal  0.114387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3550  Heat shock protein 70  46.97 
 
 
632 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.149708  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  44.88 
 
 
816 aa  246  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5965  Molecular chaperone-like protein  35.5 
 
 
861 aa  223  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000466156  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0643  chaperone protein HscA  43.67 
 
 
355 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3800  heat shock protein 70  38.03 
 
 
880 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.122258  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1651  heat shock protein 70  37.5 
 
 
631 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.660116  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1636  heat shock protein 70  37.06 
 
 
632 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1150  heat shock protein 70  34.72 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0466913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3087  Heat shock protein 70  35.99 
 
 
683 aa  150  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3585  Heat shock protein 70  32.31 
 
 
525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1501  Heat shock protein 70  32.77 
 
 
529 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1538  molecular chaperone protein DnaK  29.64 
 
 
639 aa  137  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.163821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2002  molecular chaperone DnaK  30.46 
 
 
644 aa  137  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  33.07 
 
 
872 aa  137  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2007  molecular chaperone DnaK  30.46 
 
 
644 aa  137  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1946  heat shock protein 70  32.54 
 
 
957 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253458  normal  0.635918 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  31.47 
 
 
635 aa  136  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0826  chaperone protein HscA  32.62 
 
 
621 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.353391  normal  0.61281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0350  molecular chaperone DnaK  30.63 
 
 
631 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.759772 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0677  chaperone protein HscA  32.62 
 
 
621 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0571  chaperone protein DnaK  29.92 
 
 
651 aa  135  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2811  heat shock protein Hsp70  30.79 
 
 
640 aa  134  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0535458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3218  molecular chaperone DnaK  30.26 
 
 
646 aa  134  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1873  Heat shock protein 70  30.14 
 
 
527 aa  134  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0915077  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2055  2-alkenal reductase  31.99 
 
 
623 aa  134  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.223423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2419  Heat shock protein 70  27.82 
 
 
640 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
638 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  30.23 
 
 
638 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00014  hypothetical protein  30.23 
 
 
638 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4127  molecular chaperone DnaK  28.42 
 
 
630 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0012  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
638 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2239  molecular chaperone DnaK  29.38 
 
 
644 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0425957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3642  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
638 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297376  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2733  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
643 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000184427  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0017  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
638 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276008  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0014  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
638 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.720404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0014  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
638 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0015  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
638 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0581  molecular chaperone DnaK  29.9 
 
 
639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0692  molecular chaperone DnaK  29.9 
 
 
637 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00232011  hitchhiker  0.00343274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2571  molecular chaperone DnaK  30 
 
 
646 aa  132  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0923  heat shock protein Hsp70  29.9 
 
 
645 aa  132  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.831723  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3043  molecular chaperone DnaK  30.08 
 
 
644 aa  132  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170888  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1250  molecular chaperone DnaK  28.61 
 
 
630 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.25904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4416  molecular chaperone DnaK  29.58 
 
 
638 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3964  molecular chaperone DnaK  30.48 
 
 
637 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.734974 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1181  molecular chaperone, DnaK family  28.02 
 
 
636 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0502129  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0889  molecular chaperone DnaK  30.69 
 
 
617 aa  130  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2498  molecular chaperone DnaK  30 
 
 
653 aa  130  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.821705 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0197  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
630 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432012  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2005  molecular chaperone DnaK  27.37 
 
 
619 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4505  dnaK protein  29.12 
 
 
638 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.493452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0542  molecular chaperone DnaK  29.34 
 
 
636 aa  130  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0295  molecular chaperone DnaK  28.68 
 
 
633 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0797  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
636 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000118812  normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3594  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
636 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3466  molecular chaperone DnaK  30.23 
 
 
636 aa  130  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000062983  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5231  molecular chaperone DnaK  30 
 
 
648 aa  130  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0578  molecular chaperone DnaK  30.65 
 
 
640 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.171198  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1322  molecular chaperone DnaK  29.09 
 
 
608 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0943  hypothetical protein  29.05 
 
 
621 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0513981  normal  0.126736 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3853  molecular chaperone DnaK  29.08 
 
 
635 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.458141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3624  molecular chaperone DnaK  29.38 
 
 
637 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1399  molecular chaperone DnaK  27.46 
 
 
637 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  29.34 
 
 
641 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2420  Heat shock protein 70  29.95 
 
 
649 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2580  molecular chaperone DnaK  30.83 
 
 
749 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0329  molecular chaperone DnaK  29.95 
 
 
632 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.813132  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4096  molecular chaperone DnaK  29.32 
 
 
639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2290  molecular chaperone DnaK  27.37 
 
 
619 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0145  heat shock protein 70  33.24 
 
 
577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2576  molecular chaperone DnaK  30.43 
 
 
646 aa  128  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000174764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4387  2-alkenal reductase  28.73 
 
 
578 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2058  molecular chaperone DnaK  27.11 
 
 
634 aa  128  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  29.48 
 
 
607 aa  129  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1208  molecular chaperone DnaK  27.51 
 
 
636 aa  128  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1226  molecular chaperone DnaK  29.74 
 
 
654 aa  128  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0562315  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3821  chaperone protein DnaK  30.95 
 
 
638 aa  128  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.486891  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0013  molecular chaperone DnaK  29.97 
 
 
638 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.693638  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0310  molecular chaperone DnaK  30.17 
 
 
644 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0013  molecular chaperone DnaK  29.97 
 
 
638 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.767779  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3574  chaperone protein DnaK  29.06 
 
 
639 aa  128  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.662017  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0013  molecular chaperone DnaK  29.97 
 
 
638 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169277  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3094  chaperone DnaK  29.38 
 
 
644 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0408879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0155  molecular chaperone DnaK  29.72 
 
 
632 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0402  molecular chaperone DnaK  28.05 
 
 
643 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.362768  normal  0.130805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0012  molecular chaperone DnaK  29.97 
 
 
638 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.276722  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0013  molecular chaperone DnaK  29.97 
 
 
638 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0004  chaperone protein DnaK  27.51 
 
 
638 aa  127  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0408404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1183  chaperone protein DnaK  28.89 
 
 
621 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207738 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0682  molecular chaperone DnaK  29.33 
 
 
644 aa  127  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00979445  normal  0.319162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>