More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 		 491 aa  994    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  60.04 
 
 		 487 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  57.27 
 
 		 485 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  54.23 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 		 525 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  42.74 
 
 		 520 aa  348  9e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.22 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.27 
 
 		 514 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 510 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.46 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.46 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.46 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.46 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.25 
 
 		 510 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.25 
 
 		 510 aa  320  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.25 
 
 		 510 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.25 
 
 		 510 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.83 
 
 		 510 aa  316  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 		 492 aa  300  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 569 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 583 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  37.53 
 
 		 539 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.72 
 
 		 510 aa  293  7e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 		 559 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 583 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.06 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 573 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 532 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.63 
 
 		 503 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14060  AMP-binding domain protein  33.64 
 
 		 632 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0382905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.26 
 
 		 561 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 551 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1245  AMP-binding domain protein  34.12 
 
 		 632 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.988132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.26 
 
 		 563 aa  274  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.06 
 
 		 582 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 590 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.26 
 
 		 563 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.19 
 
 		 561 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 552 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 511 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 561 aa  273  7e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.26 
 
 		 582 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.26 
 
 		 563 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.26 
 
 		 563 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 591 aa  272  9e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1567  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 		 494 aa  272  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0567369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  30.86 
 
 		 514 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  33.82 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 508 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  34.93 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  31.68 
 
 		 496 aa  270  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  32.09 
 
 		 496 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 		 508 aa  270  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 499 aa  269  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 		 508 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  32.09 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  32.09 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 561 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 512 aa  267  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 		 508 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 566 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 564 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 508 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 549 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 524 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 5154 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  32.91 
 
 		 518 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 561 aa  264  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 		 561 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 499 aa  263  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 577 aa  263  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 500 aa  262  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 526 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 585 aa  261  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 506 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.28 
 
 		 514 aa  260  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 502 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.07 
 
 		 546 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 502 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  34.82 
 
 		 516 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 520 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.71 
 
 		 570 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 504 aa  257  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 508 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 565 aa  257  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2409  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 554 aa  257  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0704611  hitchhiker  0.000109312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  42.32 
 
 		 552 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  35.48 
 
 		 506 aa  256  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 509 aa  256  9e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 549 aa  256  9e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 585 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>