80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08390  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  243  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3601  transcriptional regulator, MerR family  56.86 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3574  transcriptional regulator, MerR family  54.64 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2305  transcriptional regulator, MerR family  57.65 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0483  putative transcriptional regulator, MerR family  63.1 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2075  putative transcriptional regulator, MerR family  60.71 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.051643  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4885  transcriptional regulator, MerR family  52.08 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3496  transcriptional regulator, MerR family  55.29 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4878  transcriptional regulator, MerR family  51.04 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00750726  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2702  transcriptional regulator, MerR family  52.94 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  46.39 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1290  putative transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  39.6 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  37.37 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  38.89 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  37.63 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  41.9 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  38.3 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  36.46 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  31.78 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  35.96 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  36.17 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  30.93 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 243 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  38.54 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  32.29 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  31.4 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 289 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  33.71 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  34.78 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  30.48 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  33.66 
 
 		 242 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5847  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 296 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  39.73 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  30.33 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  33.68 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  35.05 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2025  DNA binding domain-containing protein  44.64 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 96 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  32.58 
 
 		 152 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 298 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  36.14 
 
 		 302 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  27.55 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  24 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  31.46 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0455  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  30.11 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3567  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 389 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  25.74 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 139 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>