231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
343 aa  679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 
319 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  44.73 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  45.7 
 
 
313 aa  230  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  45.37 
 
 
311 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  45.37 
 
 
311 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  45.37 
 
 
311 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  44.28 
 
 
308 aa  222  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  42.52 
 
 
310 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  43.03 
 
 
308 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3050  NUDIX hydrolase  41 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  41.14 
 
 
321 aa  195  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  50.72 
 
 
303 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  43.03 
 
 
329 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  41.32 
 
 
303 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  48.87 
 
 
332 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 
339 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  49.54 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  43.25 
 
 
326 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  36.84 
 
 
308 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  43.82 
 
 
341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3745  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.963277 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
310 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  35.01 
 
 
310 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 
318 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  44.28 
 
 
261 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8362  NAD(+) diphosphatase  43.17 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  37.05 
 
 
323 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 
307 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  48.13 
 
 
305 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
327 aa  155  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 
327 aa  155  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
321 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
317 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  45.54 
 
 
382 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
310 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  46.52 
 
 
305 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  41.18 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  46.24 
 
 
319 aa  152  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  37.19 
 
 
282 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
315 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  42.93 
 
 
315 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  45.99 
 
 
319 aa  149  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  45.99 
 
 
319 aa  149  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  45.4 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  46.45 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
306 aa  146  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  35.27 
 
 
289 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
319 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  42.79 
 
 
282 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 
301 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2476  NUDIX hydrolase  43 
 
 
352 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
358 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0784  NUDIX hydrolase  49.76 
 
 
392 aa  142  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
342 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  38.39 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  37.72 
 
 
272 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  37.05 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  38.25 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
261 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  43.52 
 
 
297 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  41.23 
 
 
278 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
281 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  41.15 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19160  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  44.98 
 
 
302 aa  136  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  41.34 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  44.63 
 
 
276 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 
262 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 
298 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  34.95 
 
 
260 aa  132  9e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  40.72 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  39.44 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  35.6 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  38.33 
 
 
327 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0985  NTP pyrophosphohydrolase  40.29 
 
 
430 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0811377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 
280 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
305 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  43.05 
 
 
265 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  42.38 
 
 
269 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  44.39 
 
 
277 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  36.32 
 
 
319 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  39.45 
 
 
283 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  39.36 
 
 
271 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  45.66 
 
 
273 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  38.89 
 
 
315 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>