157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  100 
 
 
319 aa  659    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.54 
 
 
358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.75 
 
 
347 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  39.53 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  34.26 
 
 
322 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.78 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  32.39 
 
 
353 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.28 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  28.1 
 
 
372 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  35.1 
 
 
322 aa  90.5  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  33.77 
 
 
341 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  29.17 
 
 
287 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  34.17 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.76 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  33.82 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1914  metalloprotease  28.87 
 
 
429 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  32.35 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  32.39 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1207  hypothetical protein  32.11 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.49 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.58 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.56 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1962  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.7 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  29.15 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  28.57 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.08 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.96 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.7 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.27 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  29.56 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.68 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.58 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1710  zinc binding 2  28.97 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2846  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.04 
 
 
517 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.98 
 
 
295 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  30.69 
 
 
295 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2970  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.48 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0222761 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  29.29 
 
 
288 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  29.02 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  27.88 
 
 
258 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.18 
 
 
307 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.44 
 
 
293 aa  63.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  28.57 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  28.79 
 
 
289 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.79 
 
 
289 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3451  hypothetical protein  27.62 
 
 
286 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  29.27 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.88 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.88 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.03 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  32.34 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  32.34 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.04 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  32.18 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2108  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.6 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0126988  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.57 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.09 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  29.96 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.08 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.72 
 
 
284 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  28.86 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2333  hypothetical protein  26.57 
 
 
281 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.6 
 
 
319 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  23.44 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  27.36 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0466  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.27 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  28.86 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8699  hypothetical protein  25.11 
 
 
264 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3563  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.27 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  30.9 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2313  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.44 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.87 
 
 
288 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.75 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.19 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.34 
 
 
300 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.66 
 
 
279 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.02 
 
 
292 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.02 
 
 
292 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.02 
 
 
292 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.57 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.56 
 
 
298 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0438  hypothetical protein  27.36 
 
 
292 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4019  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.19 
 
 
292 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.6 
 
 
297 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11530  predicted metalloprotease  29.69 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0775973  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.04 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0462  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.79 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.45 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6586  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.55 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  29.19 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.04 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.28 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0936  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.99 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.367422  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.28 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.655572  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29 
 
 
292 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  28.8 
 
 
291 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.32 
 
 
292 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.77 
 
 
288 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3823  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.89 
 
 
292 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8759  hypothetical protein  27.88 
 
 
261 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>