193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0890 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  43.86 
 
 
229 aa  187  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  35.37 
 
 
239 aa  129  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  30.71 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  30 
 
 
244 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  27.67 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  26.23 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  30.9 
 
 
276 aa  55.5  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  27.78 
 
 
275 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  28.71 
 
 
264 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  26.52 
 
 
269 aa  55.1  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  25.17 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  25.17 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  24.23 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  25.17 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.89 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  28.18 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  30 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  25.53 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  25.53 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  25.9 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  25.25 
 
 
234 aa  52.4  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  29.23 
 
 
244 aa  52  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  23.84 
 
 
237 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  24.83 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  24.83 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.08 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.1 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  32.17 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  29.35 
 
 
442 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4029  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  25.88 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  33.73 
 
 
1085 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.08 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
477 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  24.68 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  23.18 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  28 
 
 
417 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.06 
 
 
266 aa  48.9  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  27.96 
 
 
436 aa  48.9  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 
250 aa  48.5  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  29.25 
 
 
221 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  30 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4656  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.07 
 
 
301 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  22.28 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6098  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.58 
 
 
414 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0238295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  23.46 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.27 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  35.96 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  24.71 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  25 
 
 
249 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
244 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.51 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  27.66 
 
 
447 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  19.73 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  27.66 
 
 
447 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  30.61 
 
 
185 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  24.14 
 
 
231 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  22.99 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2823  putative methyltransferase  31.73 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364942 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2625  N-methyl-transferase-related protein  31.73 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000259265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2574  N-methyl-transferase-related protein  31.73 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000863673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  22.87 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2541  N-methyl-transferase-related protein  31.73 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000743953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  25 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.91 
 
 
390 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  39.22 
 
 
646 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  27.18 
 
 
281 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2816  N-methyl-transferase-related protein  31.73 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000601819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
237 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  26.02 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  36.25 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1446  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  24.71 
 
 
388 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220597  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  30.77 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  52.5 
 
 
230 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  25.88 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2741  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.93 
 
 
400 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
442 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  52.5 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3410  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.611266  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
257 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 
272 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  37.23 
 
 
226 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>