More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0433 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  100 
 
 
307 aa  619  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  64.36 
 
 
309 aa  381  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  62.54 
 
 
307 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  63.31 
 
 
311 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  60.13 
 
 
304 aa  363  2e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  60.13 
 
 
312 aa  354  8.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  60.13 
 
 
312 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  62.83 
 
 
309 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  60.26 
 
 
317 aa  342  5e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  56.07 
 
 
304 aa  342  7e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  58.22 
 
 
308 aa  340  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  59.55 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  54.72 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  58.69 
 
 
310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  60.26 
 
 
311 aa  335  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  58.36 
 
 
310 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  57.84 
 
 
308 aa  331  8e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  56.39 
 
 
299 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  58.77 
 
 
311 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  59.48 
 
 
309 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  55.37 
 
 
309 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  58.31 
 
 
317 aa  329  4e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  57.7 
 
 
308 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  57.52 
 
 
309 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  56.35 
 
 
310 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  56.39 
 
 
299 aa  328  6e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  57.38 
 
 
308 aa  328  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  56.96 
 
 
309 aa  328  7e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  58.5 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  56.82 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  55.37 
 
 
309 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  56.77 
 
 
301 aa  325  7e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  59.8 
 
 
309 aa  325  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  56.07 
 
 
309 aa  324  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  58.69 
 
 
327 aa  324  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  55.05 
 
 
309 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  57.38 
 
 
308 aa  324  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  57.81 
 
 
307 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  57.05 
 
 
309 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  57 
 
 
310 aa  323  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  56.86 
 
 
327 aa  322  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  57.7 
 
 
309 aa  322  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  55.05 
 
 
309 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  56.35 
 
 
324 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  56.21 
 
 
308 aa  321  9.000000000000001e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  55.74 
 
 
308 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  56.03 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  54.07 
 
 
318 aa  319  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  56.68 
 
 
326 aa  318  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  56.68 
 
 
326 aa  318  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  56.48 
 
 
307 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  54.67 
 
 
310 aa  318  9e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.25 
 
 
310 aa  318  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  56.72 
 
 
311 aa  318  9e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.25 
 
 
310 aa  318  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  56.49 
 
 
311 aa  317  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  55.7 
 
 
327 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  57.79 
 
 
309 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  59.34 
 
 
305 aa  316  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  57.47 
 
 
309 aa  316  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  59.28 
 
 
309 aa  315  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  55.37 
 
 
311 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  55.74 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  55.37 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  56.03 
 
 
310 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  55.37 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  55.7 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  53.27 
 
 
311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  58.36 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  55.37 
 
 
325 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  55.81 
 
 
320 aa  311  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  56.49 
 
 
329 aa  311  7.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  52.63 
 
 
311 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  57.24 
 
 
316 aa  310  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  54.52 
 
 
319 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  56.03 
 
 
311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  53.62 
 
 
311 aa  309  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  54.52 
 
 
307 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  56.17 
 
 
320 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  55.19 
 
 
328 aa  309  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  54.72 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  54.72 
 
 
328 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  52.79 
 
 
304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  53.18 
 
 
316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  51.96 
 
 
311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  52.94 
 
 
309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  54.1 
 
 
309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  54.37 
 
 
309 aa  306  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  53.5 
 
 
317 aa  306  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  55.95 
 
 
320 aa  306  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  52.44 
 
 
310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  53.57 
 
 
322 aa  305  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  53.62 
 
 
311 aa  305  6e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  55.41 
 
 
308 aa  305  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  53.67 
 
 
320 aa  305  7e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  54.19 
 
 
320 aa  305  7e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  52.94 
 
 
311 aa  305  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  54.67 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01381  O-acetylserine (thiol)-lyase A  54.69 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  55.08 
 
 
312 aa  302  5.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>