94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4378 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  91.67 
 
 		 60 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  67.21 
 
 		 62 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  67.86 
 
 		 63 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  67.86 
 
 		 63 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  61.29 
 
 		 62 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  66.07 
 
 		 64 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  59.68 
 
 		 62 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  65 
 
 		 61 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  62.5 
 
 		 63 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  60.71 
 
 		 63 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  60.71 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  64.29 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  62.5 
 
 		 63 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  60.71 
 
 		 63 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  60.66 
 
 		 62 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  64.29 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  57.14 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  59.68 
 
 		 62 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  56.67 
 
 		 62 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  58.18 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  50.82 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  57.14 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  55.36 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  49.09 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  48.33 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  48.33 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  48 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  51.79 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  54.55 
 
 		 69 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  51.72 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  46 
 
 		 62 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  46.3 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  45.76 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  47.46 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  48 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  46.43 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  50.98 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  44.07 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  41.67 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  49.02 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  46.55 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  41.18 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  48 
 
 		 52 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0393  hypothetical protein  42.62 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  47.06 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  47.27 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  43.64 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  36.36 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  46.3 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  49.02 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  46.94 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  43.4 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  45.28 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  48 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  40.62 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  37.29 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  42.59 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  37.5 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  48.89 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 73 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  40.82 
 
 		 66 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  43.64 
 
 		 80 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 		 63 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 		 84 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  43.08 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  35.71 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  42.59 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  36.21 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  48.98 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  43.4 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  44.9 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  35.71 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  44.83 
 
 		 410 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  44 
 
 		 62 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 		 60 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 56 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 61 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>