More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2825 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  100 
 
 
430 aa  844    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  46.61 
 
 
400 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  37.76 
 
 
402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  39.34 
 
 
423 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.57 
 
 
410 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  33.51 
 
 
396 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.16 
 
 
417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  36.27 
 
 
414 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  34.25 
 
 
421 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  34.62 
 
 
408 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  35.93 
 
 
398 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  34.26 
 
 
417 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  34.89 
 
 
399 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  35.59 
 
 
412 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  34.03 
 
 
404 aa  206  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36.89 
 
 
399 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  33.84 
 
 
409 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  34.85 
 
 
405 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  35.71 
 
 
414 aa  202  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.92 
 
 
411 aa  202  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  35.34 
 
 
412 aa  202  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.7 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  36.83 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.58 
 
 
411 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  35.32 
 
 
406 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  35.05 
 
 
436 aa  200  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37 
 
 
429 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.96 
 
 
402 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.33 
 
 
406 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.5 
 
 
407 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  35.23 
 
 
392 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  36.5 
 
 
421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.05 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  31.58 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  36.54 
 
 
416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.58 
 
 
411 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.58 
 
 
411 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  34.51 
 
 
411 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  30.85 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  35.88 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  35.68 
 
 
405 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  31.33 
 
 
411 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  31.83 
 
 
411 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  31.83 
 
 
411 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.44 
 
 
426 aa  196  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.28 
 
 
401 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  37.17 
 
 
411 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  34.17 
 
 
413 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  36.13 
 
 
414 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  33.91 
 
 
417 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.08 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.81 
 
 
412 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  37.41 
 
 
450 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.42 
 
 
408 aa  193  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  32.13 
 
 
402 aa  193  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  34.26 
 
 
405 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  37.82 
 
 
399 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  33.51 
 
 
468 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.33 
 
 
412 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  31.45 
 
 
407 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  32.55 
 
 
405 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  34.63 
 
 
413 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.49 
 
 
409 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  35.13 
 
 
410 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  35.28 
 
 
418 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  33.24 
 
 
399 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  31.87 
 
 
402 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  35 
 
 
417 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.23 
 
 
417 aa  189  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  34.42 
 
 
407 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  36.27 
 
 
404 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  33.6 
 
 
423 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.42 
 
 
407 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  33.72 
 
 
398 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  34.42 
 
 
407 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  33.5 
 
 
401 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  36.34 
 
 
427 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  31.13 
 
 
411 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  34.38 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.07 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  32.7 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  36.34 
 
 
423 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  33.99 
 
 
404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  34.64 
 
 
431 aa  183  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.17 
 
 
420 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  34.35 
 
 
443 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  34.45 
 
 
394 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  35.48 
 
 
414 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  31.93 
 
 
406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  33.6 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  32.49 
 
 
412 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  33.65 
 
 
418 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  33.75 
 
 
444 aa  179  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  36.36 
 
 
402 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  34.81 
 
 
418 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4565  cytochrome P450  33.24 
 
 
402 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4653  cytochrome P450  33.24 
 
 
402 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.974362  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  34.09 
 
 
447 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  33.84 
 
 
447 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>