More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2185 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
590 aa  1185    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  39.17 
 
 
611 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  36.24 
 
 
596 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  36.62 
 
 
592 aa  297  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  34.12 
 
 
598 aa  296  8e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  34 
 
 
595 aa  291  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  34.19 
 
 
619 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  34.23 
 
 
597 aa  281  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  35.19 
 
 
598 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  33.63 
 
 
586 aa  266  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  33.61 
 
 
584 aa  263  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.9 
 
 
543 aa  261  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  31.76 
 
 
585 aa  253  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
586 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.85 
 
 
539 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.14 
 
 
539 aa  249  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  33.84 
 
 
541 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.19 
 
 
545 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  30.07 
 
 
598 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.34 
 
 
539 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  30.03 
 
 
544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  30.8 
 
 
579 aa  241  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.12 
 
 
544 aa  240  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.12 
 
 
539 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.92 
 
 
539 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  30.97 
 
 
600 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.95 
 
 
539 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  30.02 
 
 
539 aa  233  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  29.4 
 
 
511 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  33.62 
 
 
531 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  31.62 
 
 
524 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  30.96 
 
 
580 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  31.21 
 
 
555 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  32.17 
 
 
540 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 
619 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  32.99 
 
 
523 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 
504 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  31.31 
 
 
556 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  28.83 
 
 
564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  30.84 
 
 
512 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  28.64 
 
 
564 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  29.63 
 
 
543 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  29.07 
 
 
554 aa  165  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06130  conserved hypothetical protein  32.53 
 
 
522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442853  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  29.32 
 
 
606 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  27.17 
 
 
557 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  29.48 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  32.88 
 
 
519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  27.74 
 
 
578 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  28.79 
 
 
536 aa  146  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  29.83 
 
 
559 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  27.38 
 
 
562 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  31.61 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  25.87 
 
 
624 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2129  monooxygenase FAD-binding protein  28.02 
 
 
543 aa  127  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  30.89 
 
 
498 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  31.96 
 
 
502 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  31.62 
 
 
497 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  27.15 
 
 
534 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  30.73 
 
 
520 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  31.96 
 
 
502 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  31.96 
 
 
502 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  26.66 
 
 
617 aa  125  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.45 
 
 
537 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.35 
 
 
533 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  32.14 
 
 
502 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.45 
 
 
537 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.45 
 
 
537 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  30.9 
 
 
968 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  29.72 
 
 
506 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
579 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
555 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.34 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48932  predicted protein  23.97 
 
 
721 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  27.1 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  33.79 
 
 
475 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  29.95 
 
 
509 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
555 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  30.59 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
558 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  30.52 
 
 
477 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.1 
 
 
509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  31.71 
 
 
494 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  32.28 
 
 
473 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  32.28 
 
 
473 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  30.25 
 
 
500 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  32.28 
 
 
473 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  32.07 
 
 
479 aa  114  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  30.6 
 
 
489 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  31.2 
 
 
530 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 
544 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  30.99 
 
 
506 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  28.19 
 
 
508 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.77 
 
 
552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.88 
 
 
507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>