65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0870 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  100 
 
 		 217 aa  421  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  84.72 
 
 		 217 aa  354  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  45.88 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  45.09 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  44.12 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  42.93 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  45.78 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  39.77 
 
 		 195 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  41.86 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  43.35 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  46.15 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  46.15 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  43.27 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  42.35 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  45.91 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  41.32 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  42.77 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  37.89 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  45.32 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  33.86 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  38.74 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  37.5 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  45.39 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  41.43 
 
 		 179 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  40.71 
 
 		 192 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  41.71 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  36.55 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  41.76 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  32.54 
 
 		 243 aa  88.2  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  39.01 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  39.72 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  36.71 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  35.77 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  39.73 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  35.5 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  39.04 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  29.57 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  41.38 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  35.67 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  41.55 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  31.76 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  35.76 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2256  rhomboid-like protein  32.67 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0526301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  37.93 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2134  rhomboid family protein  32.19 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00873022  decreased coverage  0.000000167975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3067  Rhomboid family protein  29.33 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00769632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  31.21 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  34.04 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  38.32 
 
 		 511 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  36.62 
 
 		 554 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  34.42 
 
 		 365 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1899  hypothetical protein  35.25 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.173429  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  34.39 
 
 		 519 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  30.26 
 
 		 487 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  30.26 
 
 		 487 aa  43.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  30.37 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.08 
 
 		 486 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  41.89 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  32.35 
 
 		 303 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  28.96 
 
 		 292 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>