More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1671 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1671  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
202 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1957  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  65.62 
 
 
200 aa  225  4e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.55991 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1642  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.17 
 
 
203 aa  123  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.15 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  31.77 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  31.25 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.5 
 
 
217 aa  84  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.9 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1180  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.69 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  29.44 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.85 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  31.5 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.5 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0140  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.46 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.37 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.16 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.19 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.15 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.16 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.61 
 
 
209 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.04 
 
 
226 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.04 
 
 
226 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27780  conserved hypothetical protein TIGR00427  27.32 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.004251  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  32.49 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.9 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  28.93 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0132  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.87 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.633264  normal  0.0179048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  30.46 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  30.46 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  30.46 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  30.46 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  29.95 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  26.4 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  30.46 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  28.93 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.64 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.89 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  28.93 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.92 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.36 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  27.14 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  27.14 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  27.14 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.8 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  27.14 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  27.14 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.5 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  27.14 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  27.14 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  27.14 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.21 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.92 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  28.93 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.93 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  28.93 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  28.93 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  28.93 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  28.93 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  28.93 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  29.53 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  28.93 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  28.93 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  27.55 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0182  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.3 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000388483  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.43 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.46 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4409  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.9 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  31.46 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  28.57 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  27.55 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.14 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.55 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.77 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.23 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.44 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  24.5 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4869  membrane protein, MarC family  29.38 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0610  multiple antibiotic resistance (MarC)-like proteins  28.72 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  27.72 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.72 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.87 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0612  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.04 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.89 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.22 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.46 
 
 
201 aa  72  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0110  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.62 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.186935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  28.57 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  32.18 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.18 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.18 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.18 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.18 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.18 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.18 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  32.18 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  32.18 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.44 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.57 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.69 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>