73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4429 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4429  putative SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 404 aa  840    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000747562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4824  putative SAM-dependent methyltransferase  65.93 
 
 		 382 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3741  putative SAM-dependent methyltransferase  60.34 
 
 		 398 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4146  putative SAM-dependent methyltransferase  54.3 
 
 		 380 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0050  putative SAM-dependent methyltransferase  54.8 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  53.54 
 
 		 365 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0131  putative SAM-dependent methyltransferase  53.79 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0127  putative SAM-dependent methyltransferase  55.15 
 
 		 364 aa  411  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0132  putative SAM-dependent methyltransferase  54.62 
 
 		 365 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4227  putative SAM-dependent methyltransferase  53.44 
 
 		 375 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0122  putative SAM-dependent methyltransferase  56.38 
 
 		 364 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  55.87 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000438589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0128  putative SAM-dependent methyltransferase  53.95 
 
 		 357 aa  405  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0097  putative SAM-dependent methyltransferase  55.62 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00919321  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0134  putative SAM-dependent methyltransferase  56.52 
 
 		 308 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02145  putative SAM-dependent methyltransferase  45.19 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003679  RNA large subunit methyltransferase F  47.59 
 
 		 375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0304  putative SAM-dependent methyltransferase  46.96 
 
 		 320 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0854  putative SAM-dependent methyltransferase  44.72 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1777  putative SAM-dependent methyltransferase  45.25 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  normal  0.316427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1491  putative SAM-dependent methyltransferase  45.25 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1596  putative SAM-dependent methyltransferase  45.25 
 
 		 321 aa  319  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2174  putative SAM-dependent methyltransferase  46.35 
 
 		 316 aa  318  7.999999999999999e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.073799  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0640  putative SAM-dependent methyltransferase  44.85 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0599  putative SAM-dependent methyltransferase  46.96 
 
 		 310 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0422684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0165  putative SAM-dependent methyltransferase  45.79 
 
 		 336 aa  316  5e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574034 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0014  putative SAM-dependent methyltransferase  46.46 
 
 		 332 aa  315  7e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0461  putative SAM-dependent methyltransferase  45.83 
 
 		 314 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0670  putative SAM-dependent methyltransferase  44.35 
 
 		 322 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0349995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14340  putative SAM-dependent methyltransferase  48.02 
 
 		 336 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  45.04 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4062  putative SAM-dependent methyltransferase  44.29 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.65293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0008  putative SAM-dependent methyltransferase  44.39 
 
 		 362 aa  307  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372689  normal  0.0118876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1470  putative SAM-dependent methyltransferase  44.06 
 
 		 336 aa  305  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1273  putative SAM-dependent methyltransferase  46.03 
 
 		 339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3621  putative SAM-dependent methyltransferase  46.36 
 
 		 319 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11590  putative SAM-dependent methyltransferase  45.2 
 
 		 335 aa  302  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2268  putative SAM-dependent methyltransferase  45.61 
 
 		 301 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0862  putative SAM-dependent methyltransferase  43.34 
 
 		 335 aa  292  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0721941  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0007  putative SAM-dependent methyltransferase  42.44 
 
 		 327 aa  292  7e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0795791  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00774  predicted SAM-dependent methyltransferase  43.34 
 
 		 308 aa  292  8e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00791  hypothetical protein  43.34 
 
 		 308 aa  292  8e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0877  putative SAM-dependent methyltransferase  43.34 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.010704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2543  putative SAM-dependent methyltransferase  43.34 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2836  putative SAM-dependent methyltransferase  43.34 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0424068  normal  0.46164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2835  protein of unknown function DUF890  43.34 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.61683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0976  putative SAM-dependent methyltransferase  44.72 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1085  putative SAM-dependent methyltransferase  43.75 
 
 		 328 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885863  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4241  putative SAM-dependent methyltransferase  44.17 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0832  putative SAM-dependent methyltransferase  41.93 
 
 		 308 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0155528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0957  putative SAM-dependent methyltransferase  43.34 
 
 		 308 aa  289  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1014  putative SAM-dependent methyltransferase  44.17 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02645  putative SAM-dependent methyltransferase  41.18 
 
 		 319 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0985  putative SAM-dependent methyltransferase  40.6 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1294  putative SAM-dependent methyltransferase  42.53 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.192476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0974  putative SAM-dependent methyltransferase  42.49 
 
 		 308 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0921  putative SAM-dependent methyltransferase  42.49 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0890  putative SAM-dependent methyltransferase  42.49 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0862  putative SAM-dependent methyltransferase  42.49 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0953  putative SAM-dependent methyltransferase  42.49 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3535  putative SAM-dependent methyltransferase  43.65 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.276675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1267  hypothetical protein  42.63 
 
 		 341 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.798225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1583  putative SAM-dependent methyltransferase  40.77 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0982  putative SAM-dependent methyltransferase  44.44 
 
 		 316 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1221  putative SAM-dependent methyltransferase  44.88 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2875  putative SAM-dependent methyltransferase  38.7 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10393  hypothetical protein  39.23 
 
 		 165 aa  129  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.946304  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04020  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 		 482 aa  121  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4809  predicted protein  25.24 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142691  decreased coverage  0.0000526989 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06713  DUF890 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05590)  24.57 
 
 		 434 aa  96.7  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1219  methyltransferase  45.59 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67775  predicted protein  22.68 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13617  normal  0.0609326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0830  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.04 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>