292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0060 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 457 aa  912    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  78.99 
 
 		 457 aa  746    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  70.24 
 
 		 457 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  69.37 
 
 		 457 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  62.58 
 
 		 457 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  41.27 
 
 		 457 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  40.43 
 
 		 457 aa  330  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  39.43 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  38.88 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  38.66 
 
 		 458 aa  286  7e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  35.59 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  35.08 
 
 		 453 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  37.12 
 
 		 455 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  35.19 
 
 		 452 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  34.33 
 
 		 452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  32.44 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  30.32 
 
 		 477 aa  179  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  36.91 
 
 		 680 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  36.59 
 
 		 680 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  35.13 
 
 		 681 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  32.24 
 
 		 480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  35.4 
 
 		 686 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  30.9 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  29.96 
 
 		 464 aa  170  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  35.74 
 
 		 676 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  34.28 
 
 		 683 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  35.91 
 
 		 686 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  29.72 
 
 		 458 aa  163  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  33.82 
 
 		 641 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  34.91 
 
 		 682 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  33.14 
 
 		 641 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  36.05 
 
 		 682 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  34.01 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  33.53 
 
 		 641 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  33.72 
 
 		 641 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  32.95 
 
 		 641 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  33.72 
 
 		 641 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  33.24 
 
 		 631 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  33.43 
 
 		 641 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  33.43 
 
 		 641 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  27.29 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  27.41 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  33.62 
 
 		 649 aa  146  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  33.62 
 
 		 649 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  34.05 
 
 		 637 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  30.72 
 
 		 688 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  32.41 
 
 		 541 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  30.47 
 
 		 637 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  34.62 
 
 		 640 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  33.86 
 
 		 681 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  32.82 
 
 		 549 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  31.04 
 
 		 638 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  30.91 
 
 		 631 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  29.5 
 
 		 920 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  30.18 
 
 		 695 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 		 553 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 		 553 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 		 553 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 		 553 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 		 553 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 		 642 aa  136  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  30.93 
 
 		 640 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  31.1 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  29.97 
 
 		 638 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  30.61 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  30.49 
 
 		 547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 		 547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  32.5 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  30.49 
 
 		 547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  30.06 
 
 		 665 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  31 
 
 		 652 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  31.72 
 
 		 645 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  27.36 
 
 		 685 aa  134  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  31.71 
 
 		 548 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 		 640 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  31.21 
 
 		 622 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  31.76 
 
 		 647 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  30.34 
 
 		 657 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  27.43 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  31.32 
 
 		 640 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  27.18 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  28.13 
 
 		 486 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  31.99 
 
 		 653 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  29.62 
 
 		 657 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  30.22 
 
 		 639 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  29.52 
 
 		 638 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  25.57 
 
 		 525 aa  126  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  31.14 
 
 		 554 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  31.14 
 
 		 554 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  30 
 
 		 619 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  31.14 
 
 		 554 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  29.25 
 
 		 546 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  29.29 
 
 		 658 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  28.98 
 
 		 657 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  25.63 
 
 		 472 aa  123  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  25.82 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>