44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7245 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7245  amine oxidase, flavin-containing  100 
 
 		 392 aa  751    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147229  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5081  glucose-inhibited division protein A  58.58 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.880262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4656  FAD dependent oxidoreductase  53.39 
 
 		 412 aa  302  8.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.708054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  27.91 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  24.48 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  24.36 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  24.12 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  25.06 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  35.34 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  25.29 
 
 		 436 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  22.84 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  25.23 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  25.23 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  46.55 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  24.48 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  30.36 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  35.82 
 
 		 488 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 487 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  45 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  23.25 
 
 		 493 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1719  amine oxidase  38.71 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0628779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2968  putative phytoene dehydrogenase  37.1 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  28.11 
 
 		 639 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  35.82 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  38.71 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1165  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase Gid  31.82 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0510605  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2683  amine oxidase  37.1 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.5 
 
 		 660 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.5 
 
 		 660 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  40.3 
 
 		 497 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  37.1 
 
 		 534 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  29.18 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  43.08 
 
 		 508 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  36.7 
 
 		 476 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0828  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.5 
 
 		 652 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  36.7 
 
 		 491 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  36.7 
 
 		 491 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  35.48 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  42.86 
 
 		 592 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1725  amine oxidase  35.48 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299467  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  34.85 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1637  UDP-galactopyranose mutase  38.81 
 
 		 383 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.5 
 
 		 652 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.574765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>