37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7101 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7101  hypothetical protein  100 
 
 		 622 aa  1170    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.95 
 
 		 331 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00244708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  29.87 
 
 		 638 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 878 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 		 306 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.25 
 
 		 810 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 685 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 762 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 638 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.32 
 
 		 887 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.7 
 
 		 340 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.31 
 
 		 632 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 1486 aa  47.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.94 
 
 		 1022 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 		 415 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  42.02 
 
 		 1079 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 767 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 615 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 643 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.73 
 
 		 784 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 1178 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.73 
 
 		 818 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 2240 aa  44.7  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  36.17 
 
 		 502 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.8 
 
 		 742 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.98 
 
 		 816 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 502 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  18.38 
 
 		 1014 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 468 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 374 aa  44.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  36.5 
 
 		 1078 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 		 502 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 792 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 607 aa  44.3  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 362 aa  43.9  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  43.66 
 
 		 566 aa  43.5  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 654 aa  43.9  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>