More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6844 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6844  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  100 
 
 		 328 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2206  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  60.49 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0440095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5068  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  59.76 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3019  dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunits  37.91 
 
 		 652 aa  208  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  38.02 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  37.11 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  40.38 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  35.46 
 
 		 328 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  35.14 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  33.03 
 
 		 659 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  34.46 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  34.97 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  36.06 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  32.12 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  32.12 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  33.54 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  33.94 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  35.26 
 
 		 710 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  34.04 
 
 		 657 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4109  Transketolase central region  33.02 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.118069  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  33.64 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  33.23 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  33.23 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  33.23 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  34.28 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  30.3 
 
 		 668 aa  143  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  30.91 
 
 		 658 aa  142  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  33.13 
 
 		 327 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  30.18 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  34.85 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.23 
 
 		 454 aa  142  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  34.85 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  35.28 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1034  Transketolase central region  36.06 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  33.13 
 
 		 324 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  34.55 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4646  Transketolase central region  34.63 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3570  Transketolase central region  34.63 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0714201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  33.43 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  33.23 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  31.02 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0763  transketolase, central region  34.91 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780624  normal  0.62016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  33.53 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  31.73 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  36.64 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  33.54 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  32.18 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2176  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  32.39 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.70271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0746  Transketolase central region  33.64 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  35.44 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  27.91 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  32.08 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  31.46 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  30.48 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46160  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  36.42 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6913  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  32.2 
 
 		 675 aa  135  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0936  acetoin catabolism protein AcoB  30.75 
 
 		 339 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  31.15 
 
 		 463 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  31.86 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  32.93 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  37.03 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.23 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  33.55 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  30.94 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  31.15 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7509  transketolase central region  35.08 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  31.46 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1610  transketolase, central region  31.99 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1944  Transketolase central region  36.17 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  31.09 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  30.16 
 
 		 659 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  29.81 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  29.91 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  29.91 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  32.52 
 
 		 388 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  30.18 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  31.23 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07151  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  32.92 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.132194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  33.64 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  34.54 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  31.23 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  30.14 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.7 
 
 		 465 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  30.14 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  33.13 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.22 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.59 
 
 		 467 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  30.77 
 
 		 659 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  31.31 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  33.23 
 
 		 356 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  32.24 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  29.86 
 
 		 344 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  29.57 
 
 		 344 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.8 
 
 		 465 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10131  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  31.29 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453962  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05600  pyruvate dehydrogenase e1 component beta subunit, mitochondrial precursor, putative  32.39 
 
 		 394 aa  132  7.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0886  Transketolase central region  32.35 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0973898  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  29.86 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  29.57 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  29.86 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>