More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6396 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
464 aa  909    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  48.21 
 
 
472 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  44.53 
 
 
524 aa  325  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
478 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  53.44 
 
 
542 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  42.49 
 
 
471 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  41.13 
 
 
498 aa  276  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
484 aa  266  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.45 
 
 
523 aa  263  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.96 
 
 
482 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  43.04 
 
 
476 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  49.14 
 
 
449 aa  249  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 
515 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 
515 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 
515 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  40.46 
 
 
504 aa  244  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2631  histidine kinase  44.88 
 
 
529 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
482 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  38.12 
 
 
566 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.53 
 
 
543 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.72 
 
 
526 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.13 
 
 
675 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0344  signal transduction histidine kinase  40 
 
 
479 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  43.53 
 
 
451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  38.95 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  38.67 
 
 
462 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
491 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.449609  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
469 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.1 
 
 
486 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.52 
 
 
477 aa  159  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
464 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.62 
 
 
461 aa  146  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
474 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  31.31 
 
 
472 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  33.12 
 
 
450 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.55 
 
 
503 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  28.93 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  35.09 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
504 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.92 
 
 
481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  31.49 
 
 
471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
466 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
466 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  31.07 
 
 
471 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.59 
 
 
466 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
455 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
470 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  33.85 
 
 
558 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  28.48 
 
 
310 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
509 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  27.37 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  31.3 
 
 
518 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  28.38 
 
 
473 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  31.97 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  31.01 
 
 
455 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  27.96 
 
 
452 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  27.96 
 
 
452 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.17 
 
 
486 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  27.96 
 
 
452 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  30.48 
 
 
468 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  29.74 
 
 
462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  27.51 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  29.8 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3007  histidine kinase  39.58 
 
 
414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  31.2 
 
 
490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  30.53 
 
 
484 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  30.53 
 
 
484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
532 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
532 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  29.04 
 
 
463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
496 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  37.29 
 
 
517 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  33.12 
 
 
469 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.02 
 
 
461 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  29.97 
 
 
484 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  32.43 
 
 
473 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  30.03 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  29.04 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.7 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.05 
 
 
455 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  29.37 
 
 
463 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  26.05 
 
 
455 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  30.43 
 
 
466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  30.18 
 
 
484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
607 aa  127  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
483 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  34.02 
 
 
470 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>