44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2937 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  245  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  41.51 
 
 
228 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4486  hypothetical protein  45.36 
 
 
218 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0757843  normal  0.0218675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2179  hypothetical protein  36.59 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.806217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  36.73 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4437  hypothetical protein  40.68 
 
 
484 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11258  hypothetical protein  47.56 
 
 
198 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144269 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  36.28 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  43.24 
 
 
219 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0532  hypothetical protein  40.45 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250908  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  44.44 
 
 
184 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3999  hypothetical protein  40 
 
 
179 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397855  normal  0.350916 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4059  hypothetical protein  40 
 
 
185 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3985  hypothetical protein  40 
 
 
185 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.97 
 
 
320 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.97 
 
 
320 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.97 
 
 
320 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2703  hypothetical protein  47.14 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1385  hypothetical protein  38.71 
 
 
282 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1385  HesB/YadR/YfhF  40 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550441  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1470  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.856687  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3032  hypothetical protein  37.78 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000576055  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2227  hypothetical protein  43.48 
 
 
322 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1709  hypothetical protein  34.15 
 
 
249 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1888  hypothetical protein  45.33 
 
 
254 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.523825  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0133  integral membrane protein  41.8 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1726  hypothetical protein  35.56 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.525839  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  35 
 
 
168 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3028  hypothetical protein  34.55 
 
 
133 aa  48.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0139  hypothetical protein  35.65 
 
 
236 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0548  hypothetical protein  36.04 
 
 
521 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2210  hypothetical protein  39.52 
 
 
235 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356074  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01100  hypothetical protein  39.82 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  35.71 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25630  hypothetical protein  35.96 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0280671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6644  hypothetical protein  43.1 
 
 
203 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00810  hypothetical protein  39.13 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.471947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2223  hypothetical protein  36.99 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5981  serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 
594 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.381836  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0271  hypothetical protein  33.61 
 
 
190 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1337  hypothetical protein  34.95 
 
 
266 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2142  hypothetical protein  32.58 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>