20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6644 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6644  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37310  hypothetical protein  31.22 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.194824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0370  hypothetical protein  39.62 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6645  hypothetical protein  44.68 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1337  hypothetical protein  34.74 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  24.9 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2937  hypothetical protein  36.84 
 
 		 129 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2826  hypothetical protein  37.93 
 
 		 172 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2969  hypothetical protein  29.52 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413192  normal  0.144689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0271  membrane protein  36.36 
 
 		 281 aa  45.8  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.317701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3589  hypothetical protein  37.35 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793233  normal  0.0200078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5175  hypothetical protein  31.03 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5264  hypothetical protein  31.03 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5556  membrane family protein  31.03 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5700  hypothetical protein  30.77 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3585  hypothetical protein  32.89 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.050073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2116  hypothetical protein  28.71 
 
 		 174 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1692  hypothetical protein  32.29 
 
 		 281 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.98 
 
 		 438 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1989  hypothetical protein  34.52 
 
 		 205 aa  42  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>