More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1772 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1772  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1105    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.100402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7440  ABC transporter, ATP-binding protein  58.54 
 
 		 620 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4037  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 591 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.073685  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1142  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  55.71 
 
 		 578 aa  535  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3109  ABC transporter related protein  55.71 
 
 		 590 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.516778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2498  ABC transporter related  52.53 
 
 		 595 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3351  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 616 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3689  ABC transporter related  42.86 
 
 		 637 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2777  ABC transporter related  46.38 
 
 		 608 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.784586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0007  ABC transporter related protein  49.91 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5093  ABC transporter related protein  42.76 
 
 		 597 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.390204 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.54 
 
 		 626 aa  362  8e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320333  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4862  ABC transporter related  45.6 
 
 		 599 aa  359  9e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.18 
 
 		 586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.67 
 
 		 586 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.67 
 
 		 586 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.67 
 
 		 586 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 586 aa  352  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.32 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.32 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4953  ABC transporter related  42.76 
 
 		 683 aa  352  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  34.93 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1968  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 619 aa  350  4e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153822  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2983  ABC transporter related  41.57 
 
 		 653 aa  347  3e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  36.79 
 
 		 583 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3667  ABC transporter related  41.67 
 
 		 617 aa  324  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.45 
 
 		 575 aa  320  6e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  34.03 
 
 		 573 aa  313  5.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0093  ABC transporter related protein  38.29 
 
 		 606 aa  307  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.15 
 
 		 587 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  33.51 
 
 		 596 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  33.4 
 
 		 575 aa  294  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0681  ABC transporter related  33.4 
 
 		 575 aa  294  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  33.56 
 
 		 601 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.8 
 
 		 598 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.85 
 
 		 579 aa  286  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 622 aa  285  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.4 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.4 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.4 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.4 
 
 		 571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.28 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  33.44 
 
 		 597 aa  280  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  30.19 
 
 		 597 aa  280  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.68 
 
 		 584 aa  279  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  30.19 
 
 		 597 aa  280  8e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.22 
 
 		 571 aa  279  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  35.83 
 
 		 610 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1345  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.28 
 
 		 599 aa  279  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0100192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1815  ABC transporter  40.05 
 
 		 370 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.22 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.22 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  32.64 
 
 		 597 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.92 
 
 		 622 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.22 
 
 		 571 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  34.74 
 
 		 582 aa  277  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.52 
 
 		 571 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  35.86 
 
 		 687 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  37.24 
 
 		 600 aa  276  7e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.75 
 
 		 572 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  30 
 
 		 612 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.28 
 
 		 605 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  31.54 
 
 		 594 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  35.5 
 
 		 567 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  32.58 
 
 		 627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  34.74 
 
 		 582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.5 
 
 		 567 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  34.41 
 
 		 603 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.63 
 
 		 572 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.49 
 
 		 650 aa  273  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 628 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.51 
 
 		 627 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.96 
 
 		 596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  34.4 
 
 		 641 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.33 
 
 		 556 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.9 
 
 		 582 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.16 
 
 		 579 aa  269  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  32.11 
 
 		 590 aa  269  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  30 
 
 		 580 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.52 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  36.3 
 
 		 654 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.14 
 
 		 600 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.82 
 
 		 580 aa  266  7e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  30.81 
 
 		 572 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  30.81 
 
 		 572 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.81 
 
 		 572 aa  266  7e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  34.89 
 
 		 638 aa  266  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  34.6 
 
 		 575 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.22 
 
 		 586 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  30.84 
 
 		 615 aa  265  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.22 
 
 		 586 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  28.52 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2828  ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 		 618 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  28.08 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.78 
 
 		 634 aa  264  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  33.11 
 
 		 588 aa  263  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  37.03 
 
 		 619 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.9 
 
 		 566 aa  263  8e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  33.14 
 
 		 639 aa  263  8.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>