34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1731 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1731  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0939  hypothetical protein  78.41 
 
 
264 aa  424  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3868  hypothetical protein  58.87 
 
 
266 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2367  hypothetical protein  43.12 
 
 
271 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1148  hypothetical protein  45.66 
 
 
268 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0824  hypothetical protein  40.24 
 
 
270 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02740  hypothetical protein  37.31 
 
 
274 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4961  hypothetical protein  36.4 
 
 
262 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00491468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2150  hypothetical protein  36.23 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1421  hypothetical protein  35.21 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.69526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1740  hypothetical protein  36.18 
 
 
263 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000684672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6744  thioesterase superfamily protein  37.75 
 
 
268 aa  111  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0659  hypothetical protein  33.73 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0296  hypothetical protein  28.62 
 
 
264 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1002  hypothetical protein  34.36 
 
 
311 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0076  hypothetical protein  29.41 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10508  hypothetical protein  32.25 
 
 
291 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0836  hypothetical protein  31.14 
 
 
282 aa  92  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.604922  normal  0.570468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0667  hypothetical protein  28.87 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0660  hypothetical protein  28.87 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.523179 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0680  hypothetical protein  28.87 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.825458  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6832  hypothetical protein  26.53 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.514909  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2429  acyl-CoA thioesterase II, putative  30.58 
 
 
284 aa  52.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5186  Acyl-CoA thioesterase-like protein  26.02 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4208  TesB-like acyl-CoA thioesterase  28.19 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1571  hypothetical protein  25.48 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421313  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10534  conserved hypothetical protein  30 
 
 
343 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152696  normal  0.163322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1900  hypothetical protein  25.57 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118355  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3513  hypothetical protein  25 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7364  hypothetical protein  23.05 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34552  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0958  hypothetical protein  26.9 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0853635  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3419  hypothetical protein  24.33 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2446  Acyl-CoA thioesterase-like protein  25.36 
 
 
271 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00478158  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23540  acyl-CoA thioesterase  25.48 
 
 
282 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.31419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>