68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1377 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  90.2 
 
 
951 bp  1197    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  87.74 
 
 
978 bp  1013    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3113  hypothetical protein  98.7 
 
 
624 bp  1160    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  82.6 
 
 
978 bp  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1377    100 
 
 
1010 bp  2002    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  86.93 
 
 
978 bp  950    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  82.6 
 
 
978 bp  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  82.84 
 
 
978 bp  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  88.1 
 
 
991 bp  1070    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  84.1 
 
 
981 bp  755    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  84.17 
 
 
978 bp  745    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  83.3 
 
 
978 bp  696    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  83.6 
 
 
978 bp  710    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  82.84 
 
 
978 bp  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  82.43 
 
 
978 bp  611  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  81.71 
 
 
978 bp  579  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  81.81 
 
 
978 bp  577  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1538    88.51 
 
 
1007 bp  569  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.987441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3114    98.33 
 
 
298 bp  545  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  81.05 
 
 
978 bp  492  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  83.4 
 
 
978 bp  478  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0945    88.94 
 
 
479 bp  450  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836757  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  80.27 
 
 
978 bp  450  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  86.93 
 
 
561 bp  412  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  83.43 
 
 
597 bp  361  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  83.43 
 
 
597 bp  361  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  81.16 
 
 
978 bp  349  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  85.44 
 
 
978 bp  347  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  85.82 
 
 
978 bp  339  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  85.17 
 
 
960 bp  337  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  82.84 
 
 
978 bp  337  4e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1859    78.99 
 
 
930 bp  325  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434219  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  83.94 
 
 
978 bp  309  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  89.12 
 
 
243 bp  268  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3575    83.64 
 
 
515 bp  226  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1571  hypothetical protein  89.34 
 
 
201 bp  216  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641007  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1889  hypothetical protein  88.32 
 
 
267 bp  208  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1728  hypothetical protein  84.94 
 
 
243 bp  188  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1858    86.96 
 
 
210 bp  153  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681721  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2394  hypothetical protein  82.32 
 
 
315 bp  115  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.176236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0134  hypothetical protein  90.22 
 
 
111 bp  111  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  89.29 
 
 
882 bp  95.6  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  81.71 
 
 
978 bp  87.7  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3809  hypothetical protein  87.95 
 
 
339 bp  85.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  83.48 
 
 
978 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  83.48 
 
 
978 bp  77.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  80.59 
 
 
717 bp  75.8  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  84.16 
 
 
978 bp  73.8  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    90.74 
 
 
1107 bp  67.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    90.74 
 
 
902 bp  67.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  82.86 
 
 
978 bp  65.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4464    82.86 
 
 
753 bp  65.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2839  hypothetical protein  86.96 
 
 
414 bp  65.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.504912  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2541    79.55 
 
 
387 bp  63.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.494511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  86.57 
 
 
981 bp  61.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  94.74 
 
 
981 bp  60  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  94.74 
 
 
978 bp  60  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  94.74 
 
 
972 bp  60  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  90 
 
 
597 bp  60  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2034  hypothetical protein  89.8 
 
 
87 bp  58  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  82.47 
 
 
978 bp  58  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0495  hypothetical protein  89.36 
 
 
171 bp  54  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  85.07 
 
 
981 bp  54  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  96.67 
 
 
990 bp  52  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  82.56 
 
 
981 bp  52  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  80.95 
 
 
978 bp  50.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  96.43 
 
 
984 bp  48.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0548    85 
 
 
446 bp  48.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>