161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4238 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4238  cytochrome B561  100 
 
 		 176 aa  356  9e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.295562 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04738  cytochrome b561  44.89 
 
 		 195 aa  160  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0135  putative cytochrome b561  44.05 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1444  cytochrome B561  42.01 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1418  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  35.67 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05609  hypothetical protein  41.35 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  29.28 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  28.11 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  28.26 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  28.11 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  27.57 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  28.09 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  27.57 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  27.57 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  26.23 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  29.55 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  27.84 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2061  cytochrome B561  30.16 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  28.73 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  25.86 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  25.82 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  29.28 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  26.44 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  26.14 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  26.34 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  25.82 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  27.43 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  26.01 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  27.43 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  23.33 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  26.37 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  26.23 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  26.23 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  27.03 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  27.32 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  26.88 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  29.14 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  25.14 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  26.18 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  25.54 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  27.17 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  27.13 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  27.84 
 
 		 421 aa  55.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  27.93 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  27.62 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  26.37 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  23.5 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  24.59 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  24.86 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  27.22 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  24.28 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  25.27 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  24.04 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  27.03 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  26.4 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  26.7 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  25.28 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  21.51 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  23.76 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  24.73 
 
 		 441 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  21.88 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  24.28 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  24.44 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  26.9 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  24.56 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.97 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  25.57 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  25.67 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  26.63 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  26.92 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  26.37 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  26.74 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  25 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0361  cytochrome b561 family protein  23.2 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  25 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1817  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  23.2 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  23.98 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05925  cytochrome b561  25.28 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0934  cytochrome b561 family protein  23.2 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  22.91 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  29.19 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0447  cytochrome b561 family protein  23.2 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0200  cytochrome b561 family protein  23.2 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1406  cytochrome b561 family protein  23.2 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  25.28 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1903  cytochrome B561  23.2 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  25.28 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  26.09 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  25.28 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2495  putative cytochrome B561  25 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.943457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  24.31 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  22.65 
 
 		 180 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  26.9 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  23.3 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  22.49 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  22.15 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  24.06 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  26.32 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>