More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3348 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
166 aa  330  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  64.81 
 
 
168 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  65.43 
 
 
168 aa  221  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  65.64 
 
 
168 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  65.43 
 
 
168 aa  201  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  65.43 
 
 
168 aa  201  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  40.24 
 
 
175 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  36.59 
 
 
178 aa  124  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.27 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  35.62 
 
 
183 aa  110  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  33.95 
 
 
182 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  33.96 
 
 
187 aa  106  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  34.34 
 
 
170 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  35.76 
 
 
174 aa  104  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  41.32 
 
 
184 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  41.32 
 
 
184 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  40.5 
 
 
184 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  29.27 
 
 
164 aa  101  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.1 
 
 
177 aa  101  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  35.9 
 
 
152 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  40.48 
 
 
184 aa  99  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.84 
 
 
174 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.81 
 
 
219 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.24 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.09 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.02 
 
 
174 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.19 
 
 
174 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  33.12 
 
 
223 aa  92  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  35.33 
 
 
169 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  38.17 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  34.68 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  31.48 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  34.15 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  31.37 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.93 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.18 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  32.68 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  33.58 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.91 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  24.22 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  35.38 
 
 
269 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.8 
 
 
178 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.4 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  34.68 
 
 
270 aa  62.4  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  29.57 
 
 
108 aa  61.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.56 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  30.17 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.56 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.58 
 
 
355 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  32.17 
 
 
176 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  33.08 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  29.86 
 
 
155 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  29.86 
 
 
155 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  29.86 
 
 
155 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  29.86 
 
 
155 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  27.27 
 
 
104 aa  57.4  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  27.64 
 
 
403 aa  57.4  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  30.63 
 
 
106 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.11 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  27.64 
 
 
403 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  34.02 
 
 
107 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  32.68 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  27.64 
 
 
191 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  30.09 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  32.03 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1155  redoxin  31.25 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  29.79 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  30 
 
 
114 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  33.33 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.3 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  30.28 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  31.78 
 
 
105 aa  55.5  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  26.24 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  28.85 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  29.91 
 
 
105 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 
193 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  25.93 
 
 
180 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  34.07 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  33.13 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  31.86 
 
 
109 aa  54.3  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.87 
 
 
363 aa  54.3  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  29.52 
 
 
165 aa  54.3  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  29.81 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  31.75 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  30.93 
 
 
107 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  32.5 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  26.32 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  27.42 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  35.04 
 
 
590 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  28.8 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  28.21 
 
 
105 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0085  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27.74 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.24 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  27.14 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  25 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  30.17 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  28.93 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  26.02 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>