More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1693 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1693  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
389 aa  727    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  42.45 
 
 
406 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  39.19 
 
 
390 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0490  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 
400 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.928419  normal  0.73631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  34.55 
 
 
390 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  35.18 
 
 
394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  38.46 
 
 
411 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
390 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  34.75 
 
 
408 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  30.29 
 
 
379 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  30.99 
 
 
390 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 
408 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  30.73 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  30.73 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  30.73 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  30.95 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  34.28 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  30.18 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
390 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0416  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
400 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 
398 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 
388 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  30.41 
 
 
431 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  37.17 
 
 
383 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  30.61 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  32.58 
 
 
392 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  34.33 
 
 
385 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  33.62 
 
 
391 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  33.33 
 
 
391 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  34 
 
 
390 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  33.33 
 
 
416 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8422  MFS transporter  37.78 
 
 
399 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  34.57 
 
 
390 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  33.05 
 
 
391 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  33.33 
 
 
391 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  33.05 
 
 
391 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  34.57 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  34.57 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  34.57 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  34.57 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  34.57 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 
397 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  35.01 
 
 
400 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  34.57 
 
 
390 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  32.3 
 
 
404 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  33.97 
 
 
412 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  32.3 
 
 
404 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  32.3 
 
 
404 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  32.3 
 
 
404 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  32.3 
 
 
404 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  32.3 
 
 
404 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  36.36 
 
 
391 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0483  major facilitator transporter  35.03 
 
 
426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.964479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 
385 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  31.83 
 
 
404 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
404 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  32.76 
 
 
391 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  31.55 
 
 
415 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  33.71 
 
 
399 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  33.33 
 
 
405 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  33.71 
 
 
409 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  33.71 
 
 
399 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  32.39 
 
 
396 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  35.29 
 
 
389 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  30.9 
 
 
421 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  31.55 
 
 
415 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  31.55 
 
 
404 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  32.29 
 
 
400 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  31.37 
 
 
390 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  35.03 
 
 
389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  35.03 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  35.03 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  33.52 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  35.03 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  34.62 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  35.03 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  33.43 
 
 
409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  35.03 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  35.03 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  31.28 
 
 
404 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  33.81 
 
 
389 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  33.06 
 
 
378 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  33.52 
 
 
389 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  33.52 
 
 
389 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  36.72 
 
 
388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  31.18 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  36.72 
 
 
388 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 
388 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  31.28 
 
 
404 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2491  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 
419 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259249  normal  0.0455344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  32.47 
 
 
391 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  34.2 
 
 
389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  31.79 
 
 
400 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  31.01 
 
 
394 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  31.78 
 
 
391 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  33.83 
 
 
388 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>