32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0406 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0406  secretion protein snm4  100 
 
 		 465 aa  900    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0678  secretion protein snm4  42.45 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.939743  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  38.51 
 
 		 470 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  35.84 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0608  secretion protein snm4  32.98 
 
 		 468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0693  secretion protein snm4  29.8 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  31.37 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0475  hypothetical protein  29.59 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  29.15 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4752  hypothetical protein  31.69 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3148  secretion protein snm4  29.65 
 
 		 484 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1439  hypothetical protein  28.45 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0240093  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  38.73 
 
 		 464 aa  95.1  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8521  secretion protein snm4  41.32 
 
 		 489 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0138831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8475  secretion protein snm4  42.86 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4838  hypothetical protein  34.59 
 
 		 468 aa  83.2  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0940  hypothetical protein  29.14 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  26.88 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  26.11 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3204  protein of unknown function DUF571  32.09 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.245155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4960  hypothetical protein  28.57 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5564  hypothetical protein  24.57 
 
 		 472 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0944737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5967  hypothetical protein  24.57 
 
 		 472 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7883  secretion protein snm4  37.84 
 
 		 646 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390406  normal  0.0390775 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  28.1 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4811  secretion protein snm4  33.33 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0032903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0307  CD9/CD37/CD63 antigen  27.84 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00186482  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0332  secretion protein snm4  31.07 
 
 		 528 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13912  transmembrane protein  23.76 
 
 		 479 aa  44.3  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000584195  normal  0.954546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0063  hypothetical protein  25.23 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0508702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0764  hypothetical protein  25.51 
 
 		 486 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  32.43 
 
 		 497 aa  43.5  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>