59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_R0028 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0457  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 84 bp  77.8  0.0000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.174165  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0031  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 84 bp  67.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0026  tRNA-Leu  95 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802213  normal  0.744604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 87 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4050  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00460724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0053  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0148757  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0796  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4275  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0018  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0036  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.773561  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0018  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.864301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0075  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.537115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0013  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0037  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0035  tRNA-Leu  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0047  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.306057  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0248766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0066  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0015  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.629999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0021  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0023  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0024  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522989  normal  0.148757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>