19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_R0041 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0038  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0030  tRNA-Leu  85.06 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0031  tRNA-Leu  83.91 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0023  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0188158  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0028  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6027  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0853509  normal  0.33546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0128  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000373913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t094  tRNA-Leu  82.76 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t58  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334218  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu01  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0021  tRNA-Leu  84.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0051  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0035  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0072  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828257  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0048  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0028  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>