More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1371 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1371  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  36.14 
 
 
219 aa  82  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 
224 aa  82  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  30.1 
 
 
231 aa  80.9  0.000000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  36.46 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  28.86 
 
 
223 aa  79  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.79 
 
 
442 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.22 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
216 aa  74.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  35.5 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.4 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0752  phosphoglycerate mutase family protein  35.15 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.05 
 
 
442 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  34.91 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
215 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
215 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
215 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
215 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
215 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0327  phosphoglycerate mutase family protein  31.05 
 
 
229 aa  72  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103496  hitchhiker  7.17223e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  33.54 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0357  Phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.806672  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
222 aa  71.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.19 
 
 
222 aa  71.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
214 aa  70.9  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  32.98 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  33.74 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  31.95 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  39.05 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
448 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 
223 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.14 
 
 
442 aa  67  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.33 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.7 
 
 
442 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  26.19 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  41.84 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  31.07 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  42.59 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  40.82 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
445 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  31.89 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  28.09 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  31.93 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>