More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4681 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 345 aa  702    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  51.36 
 
 		 308 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 		 438 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 287 aa  99.4  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 305 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  31.95 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 413 aa  86.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 309 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  29.46 
 
 		 1065 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  31.34 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 		 528 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  30.59 
 
 		 561 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 1268 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 924 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.58 
 
 		 754 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 1435 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  31.39 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2393  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 281 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  28.87 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.05 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 		 753 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  30.73 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 884 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1192  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 		 853 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00970653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  26.98 
 
 		 302 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.46 
 
 		 2401 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.8 
 
 		 1119 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  28.7 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0345  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0405304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 525 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 619 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.9 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 891 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 1162 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  31.03 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  31.03 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0602  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.58 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000299087  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  22.45 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  36.54 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1306  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  30.85 
 
 		 672 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1342  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  23.04 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.56 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>