36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4485 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  359  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  39.86 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  37.88 
 
 		 148 aa  84.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  34.81 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  34.23 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  33.09 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  29.29 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  29.2 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  26.92 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  29.2 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  29.5 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  30.88 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  31.06 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  29.66 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  28.35 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  32.84 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  25.83 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  25.83 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  26.53 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  35.38 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  36.26 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  22.38 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  35.87 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  27.66 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  32.11 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  28.95 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  25.37 
 
 		 148 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02108  hypothetical protein  32.04 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  23.03 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  29.29 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  25.68 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  25.2 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  26.52 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  25.53 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  26.95 
 
 		 137 aa  41.2  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>