31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2628 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  100 
 
 		 356 aa  698    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  51.88 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  51.17 
 
 		 379 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  49.87 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  51.8 
 
 		 356 aa  282  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  53.46 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  48.75 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  53.46 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  31.17 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3201  putative signal peptide protein  41.75 
 
 		 148 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  28.77 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  30 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  32.13 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  33.12 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  28.49 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  25.3 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  28.75 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  29.18 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  29.37 
 
 		 450 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0214  hypothetical protein  29.79 
 
 		 189 aa  54.3  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.220616  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1680  hypothetical protein  32 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3245  hypothetical protein  34.04 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  31.72 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1901  hypothetical protein  31.68 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  28.97 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3613  hypothetical protein  29.81 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  32.03 
 
 		 471 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0685  TolA family protein  32.08 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4428  hypothetical protein  27.88 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  30.56 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>