34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1059 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  733    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  50.81 
 
 		 381 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  50.94 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  44.47 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  40.1 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  40.71 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  39.67 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  36.39 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  38.46 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  44.15 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  37.18 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  37.5 
 
 		 391 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  41.86 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  39.1 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  38.36 
 
 		 565 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  38.08 
 
 		 565 aa  172  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  37.85 
 
 		 553 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  39.93 
 
 		 503 aa  170  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  36.86 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  31.93 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  29.06 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  27.74 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  27.02 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  26.26 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  30.89 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1839  hypothetical protein  26.77 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  25.23 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  25 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0476  hypothetical protein  31.92 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.98066  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  30.12 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  26.24 
 
 		 444 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3551  hypothetical protein  29.92 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2020  hypothetical protein  30.16 
 
 		 369 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  30.4 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>