261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0256 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 139 aa  280  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  72.99 
 
 		 138 aa  221  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  71.53 
 
 		 138 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  70.29 
 
 		 145 aa  214  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  67.39 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  64.49 
 
 		 139 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  62.77 
 
 		 138 aa  191  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  60.14 
 
 		 139 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  62.04 
 
 		 138 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  61.31 
 
 		 138 aa  183  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  62.77 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  61.31 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  60.29 
 
 		 138 aa  180  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  62.04 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  60.74 
 
 		 137 aa  170  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  59.85 
 
 		 138 aa  167  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  59.85 
 
 		 138 aa  167  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  50.75 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  51.88 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  53.38 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  51.15 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  54.01 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  47.37 
 
 		 135 aa  144  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  53.28 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  53.28 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  51.13 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  50.39 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  44.62 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  48.85 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  44.53 
 
 		 137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  46.56 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  45.59 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  48.57 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  43.38 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  43.38 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.1 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.72 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.1 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  35.4 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.71 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.93 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.43 
 
 		 146 aa  97.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  41.18 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  43.9 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.11 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.36 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4075  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.83 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.402367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.97 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.06 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.06 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.73 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.57 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.15 
 
 		 138 aa  93.6  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.97 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.41 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.19 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  36.43 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  36.43 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  36.43 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  36.43 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  36.43 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  36.43 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  36.43 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.84 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.1 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.81 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.44 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.12 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  35 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.21 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.61 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.35 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.46 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.25 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  37.04 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  35 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  35 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.11 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.14 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  35.53 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.46 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  35.82 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.3 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  32.48 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.83 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.1 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  39.34 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>