More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2592 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
256 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  61.54 
 
 
247 aa  314  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  50.41 
 
 
245 aa  254  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  45.53 
 
 
249 aa  234  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0567  glycosyl transferase family 2  42 
 
 
252 aa  229  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00524671  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  44.13 
 
 
247 aa  224  8e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.72 
 
 
247 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  43.78 
 
 
248 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  42.23 
 
 
257 aa  214  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  44.02 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  40.16 
 
 
249 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 
249 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0402  glycosyl transferase family 2  37.35 
 
 
262 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.811169  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4110  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 
253 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  40.74 
 
 
258 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1845  hypothetical protein  34.57 
 
 
253 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  37.33 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
293 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0750  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.04 
 
 
248 aa  119  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
273 aa  115  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4274  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
320 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
269 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0525  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
296 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
285 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 
265 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
244 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
260 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
272 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
272 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 
266 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0709  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
249 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
295 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0738  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
249 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.751434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
272 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3805  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
302 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
1037 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  40.32 
 
 
342 aa  99.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  37.78 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
974 aa  98.6  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.45 
 
 
274 aa  98.6  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  42.48 
 
 
718 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 
450 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
283 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  42.28 
 
 
325 aa  95.9  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  50.56 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  35.26 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  34.72 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2027  glycosly transferase  29.11 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.560112  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  44.57 
 
 
605 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1538  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.730305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0779  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
296 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2837  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281659  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 
295 aa  92.4  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  46.67 
 
 
327 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
297 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2563  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142563  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  36.29 
 
 
318 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2582  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
243 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  34.19 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
390 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 
286 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1586  putative glycosyl transferase  32.89 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
1067 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 
318 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
293 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
663 aa  86.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01961  predicted glycosyl transferase  33.03 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
268 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01950  hypothetical protein  33.03 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  43.2 
 
 
321 aa  86.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
363 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
315 aa  85.9  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
847 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2348  putative glycosyl transferase  32.59 
 
 
251 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
331 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
279 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1007  putative glycosyl transferase  32.13 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
299 aa  85.1  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1602  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.73 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  30.62 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2990  putative glycosyl transferase  32.89 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000927401 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
581 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1177  putative glycosyl transferase  32.58 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>