45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1374 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1374  hypothetical protein  100 
 
 		 705 aa  1432    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2587  hypothetical protein  49.72 
 
 		 690 aa  703    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.293714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1084  hypothetical protein  37.71 
 
 		 690 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0618906  normal  0.145562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0697  hypothetical protein  30.26 
 
 		 695 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08231  hypothetical protein  25.79 
 
 		 677 aa  208  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1340  hypothetical protein  27.07 
 
 		 712 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2888  hypothetical protein  25.15 
 
 		 675 aa  167  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00132631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2645  protein of unknown function DUF1355  22.43 
 
 		 761 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2739  protein of unknown function DUF1355  22.12 
 
 		 761 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4088  protein of unknown function DUF1355  24.24 
 
 		 838 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0545012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1221  hypothetical protein  22.12 
 
 		 761 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1456  hypothetical protein  26.64 
 
 		 696 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113684  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1733  protein of unknown function DUF1355  26.45 
 
 		 696 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1804  hypothetical protein  22.28 
 
 		 878 aa  79.7  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4483  hypothetical protein  31.98 
 
 		 692 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3638  hypothetical protein  29.46 
 
 		 693 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5168  protein of unknown function DUF1355  32.64 
 
 		 692 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1453  hypothetical protein  28.24 
 
 		 696 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0355203  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2548  hypothetical protein  26.12 
 
 		 759 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  21.95 
 
 		 796 aa  65.1  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1189  hypothetical protein  27.05 
 
 		 687 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2278  hypothetical protein  23.41 
 
 		 689 aa  62  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1292  hypothetical protein  26.46 
 
 		 687 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2268  hypothetical protein  26.58 
 
 		 687 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.967855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2231  hypothetical protein  24.46 
 
 		 691 aa  57.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1373  hypothetical protein  26.01 
 
 		 687 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2629  hypothetical protein  25.71 
 
 		 687 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.498144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  22.97 
 
 		 687 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3254  hypothetical protein  23.77 
 
 		 687 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  22.65 
 
 		 724 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2795  hypothetical protein  24.39 
 
 		 689 aa  51.2  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79897  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3059  protein of unknown function DUF1355  24.39 
 
 		 689 aa  50.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  24.35 
 
 		 687 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0686  hypothetical protein  25.89 
 
 		 688 aa  50.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503271  normal  0.203205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  22.38 
 
 		 688 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2270  protein of unknown function DUF1355  22.76 
 
 		 699 aa  48.9  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2182  hypothetical protein  25.19 
 
 		 690 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1010  hypothetical protein  23.69 
 
 		 695 aa  48.5  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3233  hypothetical protein  23.97 
 
 		 689 aa  48.9  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2945  hypothetical protein  28.23 
 
 		 688 aa  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0136  conserved hypothetical protein-putative transmembrane protein  20.75 
 
 		 732 aa  48.1  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1507  hypothetical protein  25.18 
 
 		 689 aa  47.4  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.306187  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2004  hypothetical protein  23.98 
 
 		 670 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1559  hypothetical protein  25.55 
 
 		 691 aa  46.2  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.820703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3475  hypothetical protein  21.12 
 
 		 731 aa  44.3  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>