More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1125 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1125  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
623 aa  1255    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.994939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0709  NADH dehydrogenase (quinone)  54.72 
 
 
630 aa  680    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.807832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17880  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 5  62.7 
 
 
622 aa  807    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4409  NADH dehydrogenase (quinone)  34.94 
 
 
464 aa  243  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.488164  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5482  NADH dehydrogenase (quinone)  36.13 
 
 
847 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0120155  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2597  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.49 
 
 
453 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0513  NADH ubiquinone/plastoquinone complex subunit, putative  36.18 
 
 
509 aa  195  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1250  NADH dehydrogenase (quinone)  34.28 
 
 
513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0566  NADH-ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5/L, N-terminal:NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.99 
 
 
508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0758963  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.99 
 
 
628 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.33 
 
 
642 aa  165  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.6 
 
 
637 aa  164  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.53 
 
 
643 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  29.94 
 
 
695 aa  162  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  29.38 
 
 
687 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.08 
 
 
666 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.16 
 
 
618 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.54 
 
 
667 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.48 
 
 
668 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.17 
 
 
670 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.75 
 
 
634 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  31.71 
 
 
614 aa  157  7e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  32.56 
 
 
715 aa  157  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2527  NADH dehydrogenase subunit L  31.96 
 
 
720 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  31.42 
 
 
613 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  31.42 
 
 
613 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  31.42 
 
 
613 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  29.27 
 
 
719 aa  156  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1189  NADH dehydrogenase subunit L  31.96 
 
 
720 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495317  normal  0.332417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  28.46 
 
 
682 aa  156  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  31.59 
 
 
611 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  30.54 
 
 
654 aa  156  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.61 
 
 
650 aa  156  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  30.93 
 
 
695 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  31.59 
 
 
611 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  28.16 
 
 
662 aa  156  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.35 
 
 
667 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  29.58 
 
 
724 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1866  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain L  32.66 
 
 
610 aa  155  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.83 
 
 
618 aa  154  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  32.77 
 
 
613 aa  154  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1746  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  28.08 
 
 
696 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275907  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  30.33 
 
 
692 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.61 
 
 
667 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.58 
 
 
627 aa  153  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.13 
 
 
613 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  31.13 
 
 
613 aa  153  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  29.83 
 
 
613 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  28.84 
 
 
657 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  31.13 
 
 
613 aa  153  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  30.18 
 
 
664 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  31.13 
 
 
613 aa  153  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.13 
 
 
660 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  33.02 
 
 
711 aa  153  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  30.83 
 
 
611 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  30.66 
 
 
613 aa  153  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.59 
 
 
710 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  30.66 
 
 
613 aa  153  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  32.13 
 
 
654 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  30.92 
 
 
679 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.27 
 
 
675 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  30.92 
 
 
679 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  30.92 
 
 
679 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  28.84 
 
 
657 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  30.92 
 
 
679 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  30.83 
 
 
611 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  33.78 
 
 
614 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  30.92 
 
 
669 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  30.92 
 
 
679 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  30.92 
 
 
679 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  30.92 
 
 
679 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  33.78 
 
 
614 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  30.39 
 
 
613 aa  152  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  33.78 
 
 
614 aa  152  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.18 
 
 
641 aa  152  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.99 
 
 
652 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  32.57 
 
 
689 aa  151  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  31.32 
 
 
616 aa  151  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.29 
 
 
683 aa  151  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  31.02 
 
 
654 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  30.11 
 
 
650 aa  150  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  29.84 
 
 
691 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.12 
 
 
686 aa  150  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  28.89 
 
 
610 aa  150  6e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  30.42 
 
 
664 aa  150  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  31.48 
 
 
621 aa  150  7e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.52 
 
 
676 aa  150  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.67 
 
 
681 aa  150  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2233  NADH dehydrogenase subunit L  32.63 
 
 
703 aa  150  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.64 
 
 
631 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  34.14 
 
 
617 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  27.2 
 
 
669 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.12 
 
 
654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  29.74 
 
 
682 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  29.08 
 
 
689 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  32.06 
 
 
666 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  31.64 
 
 
654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  32.43 
 
 
706 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  26.36 
 
 
713 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.79 
 
 
674 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>