More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 311 aa  600  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  31.4 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  35.39 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  35.39 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.39 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  35.39 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1805  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.84 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.27 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.27 
 
 		 303 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  34.02 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  35.93 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  32.2 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  34.74 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  36.99 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  32.41 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.98 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  26.21 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.67 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  29.86 
 
 		 305 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  32.27 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.27 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  35.62 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  35.62 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  30.29 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.27 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  29.3 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.62 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  35.21 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  30.29 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  38.21 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  33.18 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  32.84 
 
 		 230 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  40.1 
 
 		 238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  30.73 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  29.46 
 
 		 300 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  30.73 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  30.73 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  30.73 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  31.22 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  29.95 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  34.91 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  32.11 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  31.82 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  33.99 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1167  ABC transporter related  36 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95797  normal  0.478862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  30.29 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  37.07 
 
 		 876 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.64 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  30 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  32.16 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  32.11 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  34.1 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  33.03 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  34.91 
 
 		 866 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  34.82 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  34.9 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2338  ABC transporter-like protein  32.66 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  30.41 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  31.84 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  35.94 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  30.67 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  36.28 
 
 		 234 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  35.61 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  32.42 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  29.63 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  31.36 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  33.98 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  34.35 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0784  ABC transporter related protein  28.51 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.217947  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1845  ABC transporter related  28.5 
 
 		 220 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  31.48 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  29.52 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1523  ABC transporter related  31.05 
 
 		 220 aa  106  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.667428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.11 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  35.64 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  33.98 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  31.63 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  34.51 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  35.58 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  34.43 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  33.61 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  34.69 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.88 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  35.4 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  32.06 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  32.65 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  35.29 
 
 		 968 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1356  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 814 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>