More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08740 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20900  nucleotide sugar dehydrogenase  73.49 
 
 
441 aa  644    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08740  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
433 aa  860    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160472  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08980  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  75.7 
 
 
436 aa  634    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4212  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.2 
 
 
433 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1691  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  66.36 
 
 
427 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  decreased coverage  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1693  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  67.06 
 
 
427 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7622  nucleotide sugar dehydrogenase  59.05 
 
 
443 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5916  nucleotide sugar dehydrogenase  54.96 
 
 
424 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5182  nucleotide sugar dehydrogenase  37.86 
 
 
503 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0203  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.25 
 
 
447 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.211855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3014  nucleotide sugar dehydrogenase  37.05 
 
 
544 aa  226  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0488  nucleotide sugar dehydrogenase  37.53 
 
 
462 aa  220  5e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0347136  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2029  nucleotide sugar dehydrogenase  38.04 
 
 
455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1709  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.41 
 
 
449 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.676622  normal  0.0907516 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1530  nucleotide sugar dehydrogenase  34.49 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1457  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.48 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0554439  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0496  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.06 
 
 
449 aa  213  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  33.02 
 
 
437 aa  212  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  38.08 
 
 
439 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  33.58 
 
 
435 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.68 
 
 
432 aa  207  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  33.69 
 
 
424 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.03 
 
 
434 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1766  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.87 
 
 
445 aa  200  5e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000194311 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  30.5 
 
 
418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0085  nucleotide sugar dehydrogenase  30.5 
 
 
431 aa  196  7e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896059 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1063  nucleotide sugar dehydrogenase  32.43 
 
 
433 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  36.14 
 
 
434 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.14 
 
 
434 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4967  N-acylmannosamine 1-dehydrogenase (UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase); capsular polysaccharide synthesis enzyme  31.28 
 
 
427 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  37.23 
 
 
437 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2304  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.62 
 
 
457 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.83 
 
 
427 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.094226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.94 
 
 
435 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5120  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  32.01 
 
 
427 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5362  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  32.01 
 
 
427 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5512  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  32.01 
 
 
427 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  35.28 
 
 
416 aa  192  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1952  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase dimerisation  32.69 
 
 
460 aa  191  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.868357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  32.95 
 
 
451 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1854  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.02 
 
 
408 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0701839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3116  nucleotide sugar dehydrogenase  31.67 
 
 
424 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000525581  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0149  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.39 
 
 
420 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0154  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.39 
 
 
420 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.88 
 
 
435 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5563  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  32.08 
 
 
427 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  34.4 
 
 
453 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1584  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.03 
 
 
427 aa  186  7e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260621  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  31.19 
 
 
453 aa  186  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.7 
 
 
438 aa  186  9e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.49 
 
 
418 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3042  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.8 
 
 
419 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.247493  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.76 
 
 
439 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2029  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.82 
 
 
472 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  34.86 
 
 
417 aa  179  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  33.69 
 
 
446 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  33.42 
 
 
439 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1591  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.03 
 
 
431 aa  178  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117032  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.88 
 
 
403 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000650417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  31.19 
 
 
447 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1733  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.77 
 
 
427 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.720088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.68 
 
 
450 aa  176  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1195  nucleotide sugar dehydrogenase  37.7 
 
 
417 aa  176  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100781  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.65 
 
 
441 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  40.35 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0178  nucleotide sugar dehydrogenase  27.54 
 
 
427 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0870  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.54 
 
 
427 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.710609  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  28.34 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27920  nucleotide sugar dehydrogenase  36.87 
 
 
417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2378  nucleotide sugar dehydrogenase  30.22 
 
 
460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000447679  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.95 
 
 
439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0442  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  32.2 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  33.78 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  34.03 
 
 
448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.49 
 
 
449 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08960  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  38.71 
 
 
418 aa  172  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0633  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.67 
 
 
435 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.05 
 
 
420 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0027  nucleotide sugar dehydrogenase  34.05 
 
 
455 aa  170  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6019  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.69 
 
 
414 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892071  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0506  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.62 
 
 
412 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1016  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.05 
 
 
423 aa  169  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  28.68 
 
 
428 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3148  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.33 
 
 
434 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442778  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  32.51 
 
 
461 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3696  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.07 
 
 
418 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  32.51 
 
 
441 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  33.6 
 
 
440 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  33.87 
 
 
440 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  32.51 
 
 
440 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2117  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.33 
 
 
444 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.95445  decreased coverage  0.00397041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4052  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.85 
 
 
412 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  33.51 
 
 
418 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1390  nucleotide sugar dehydrogenase  31.26 
 
 
420 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.64 
 
 
435 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0430  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  29 
 
 
416 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0727334 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.57 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0049  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.59 
 
 
476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.07 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.62 
 
 
505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>