More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1693 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1691  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  97.42 
 
 
427 aa  800    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  decreased coverage  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1693  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
427 aa  853    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08980  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  70.26 
 
 
436 aa  594  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08740  nucleotide sugar dehydrogenase  67.06 
 
 
433 aa  558  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160472  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20900  nucleotide sugar dehydrogenase  61.92 
 
 
441 aa  519  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4212  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  60.68 
 
 
433 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7622  nucleotide sugar dehydrogenase  64.17 
 
 
443 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5916  nucleotide sugar dehydrogenase  55.72 
 
 
424 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5182  nucleotide sugar dehydrogenase  39.62 
 
 
503 aa  235  9e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3014  nucleotide sugar dehydrogenase  37.53 
 
 
544 aa  234  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0203  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.8 
 
 
447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.211855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2029  nucleotide sugar dehydrogenase  37.53 
 
 
455 aa  230  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0496  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.55 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1709  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.24 
 
 
449 aa  220  5e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.676622  normal  0.0907516 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  31.84 
 
 
418 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1766  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.57 
 
 
445 aa  219  6e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000194311 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1530  nucleotide sugar dehydrogenase  34.55 
 
 
449 aa  216  4e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1457  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.34 
 
 
390 aa  217  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0554439  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0488  nucleotide sugar dehydrogenase  35.7 
 
 
462 aa  213  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0347136  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0085  nucleotide sugar dehydrogenase  31.46 
 
 
431 aa  209  9e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  33.33 
 
 
437 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33 
 
 
427 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.094226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.06 
 
 
432 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  33.78 
 
 
435 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1063  nucleotide sugar dehydrogenase  32.27 
 
 
433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  37.7 
 
 
416 aa  199  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5563  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  32.25 
 
 
427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  35.97 
 
 
439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.27 
 
 
418 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1952  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase dimerisation  35.96 
 
 
460 aa  196  6e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.868357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  34.02 
 
 
437 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  32 
 
 
424 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.16 
 
 
434 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  34.98 
 
 
453 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.03 
 
 
438 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1584  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.23 
 
 
427 aa  189  7e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260621  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0178  nucleotide sugar dehydrogenase  28.94 
 
 
427 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1854  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  32.54 
 
 
408 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0701839  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  35.14 
 
 
461 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3116  nucleotide sugar dehydrogenase  30.58 
 
 
424 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000525581  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2304  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.4 
 
 
457 aa  187  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5120  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  28.24 
 
 
427 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5512  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  28.24 
 
 
427 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5362  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  28.24 
 
 
427 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  32.63 
 
 
446 aa  186  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  31.65 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.94 
 
 
420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4967  N-acylmannosamine 1-dehydrogenase (UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase); capsular polysaccharide synthesis enzyme  28.7 
 
 
427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1733  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.24 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.720088 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0870  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.01 
 
 
427 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.710609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  34.92 
 
 
420 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2117  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.56 
 
 
444 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.95445  decreased coverage  0.00397041 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.34 
 
 
434 aa  179  9e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  34.34 
 
 
434 aa  179  9e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.15 
 
 
435 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  32.43 
 
 
432 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  35.17 
 
 
418 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  34.07 
 
 
451 aa  176  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.67 
 
 
435 aa  176  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1591  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.19 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117032  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.09 
 
 
439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.24 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1016  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.95 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1818  nucleotide sugar dehydrogenase  28 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000156601  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  34.05 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0149  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.44 
 
 
420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0154  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.44 
 
 
420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3871  nucleotide sugar dehydrogenase  31.55 
 
 
407 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  30.2 
 
 
428 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  33.8 
 
 
439 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.78 
 
 
438 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0633  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.4 
 
 
435 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30 
 
 
441 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.81 
 
 
450 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1195  nucleotide sugar dehydrogenase  36.2 
 
 
417 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100781  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  33.77 
 
 
440 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  32.15 
 
 
441 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4151  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  28.37 
 
 
420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03665  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid dehydrogenase  28.37 
 
 
420 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4189  nucleotide sugar dehydrogenase  28.37 
 
 
420 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4004  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  28.37 
 
 
420 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5220  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  28.37 
 
 
420 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.248678  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4216  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  28.37 
 
 
420 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03614  hypothetical protein  28.37 
 
 
420 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.56 
 
 
438 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6019  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.7 
 
 
414 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892071  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  32.35 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4298  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  28.14 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3999  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  28.31 
 
 
420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.762398  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.2 
 
 
448 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4134  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  28.14 
 
 
420 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.24 
 
 
449 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0098  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.33 
 
 
426 aa  163  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15381  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0430  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  28.87 
 
 
416 aa  163  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0727334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  32.11 
 
 
448 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  31.49 
 
 
440 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0641  nucleotide sugar dehydrogenase  30.97 
 
 
427 aa  163  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.08 
 
 
505 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  29.11 
 
 
447 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08960  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  34.81 
 
 
418 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>